This content is Free Access.
Chapitres
- 00:05Titre
- 02:21Running the I-TASSER Server
- 03:37Structure Analysis
- 05:58LOMETS Target Template Alignment
- 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
- 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
- 12:05Representative I-TASSER Results
- 15:43Conclusion
Richtlijnen voor de computer op basis van structurele en functionele karakterisering van eiwitten met behulp van de I-TASSER pijplijn is beschreven. Vanaf vraag eiwitsequentie, zijn 3D-modellen gegenereerd met behulp van meerdere threading uitlijningen en iteratief structurele assemblage simulaties. Functionele gevolgtrekkingen worden daarna getrokken op basis van wedstrijden om eiwitten met bekende structuur en functies.
Tags
ProtocolComputer-basedProtein StructureFunction PredictionGenome Sequencing ProjectsProtein SequenceStructure And Function KnowledgeExperimental MethodsComputational ModelingI-TASSER ServerSecondary Structure PredictionSolvent Accessibility PredictionHomologous Template ProteinsStructure AlignmentsTertiary Structural ModelsStructure-based Functional AnnotationsConfidence ScoreEnd UsersUser-specified Inter-residue DistanceContact MapsI-TASSER ModelingTemplate ProteinsStructure Assembly Simulations
