This content is Free Access.
Chapitres
- 00:05Titre
- 02:21Running the I-TASSER Server
- 03:37Structure Analysis
- 05:58LOMETS Target Template Alignment
- 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
- 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
- 12:05Representative I-TASSER Results
- 15:43Conclusion
Retningslinjer for computerbaseret strukturelle og funktionelle karakterisering af protein ved hjælp af I-TASSER rørledningen er beskrevet. Fra forespørgsel protein sekvens, er 3D-modeller genereret ved hjælp af flere tråde alignments og iterativ strukturelle samling simuleringer. Funktionelle slutninger er derefter trukket baseret på kampe til proteiner med kendt struktur og funktioner.
Tags
ProtocolComputer-basedProtein StructureFunction PredictionGenome Sequencing ProjectsProtein SequenceStructure And Function KnowledgeExperimental MethodsComputational ModelingI-TASSER ServerSecondary Structure PredictionSolvent Accessibility PredictionHomologous Template ProteinsStructure AlignmentsTertiary Structural ModelsStructure-based Functional AnnotationsConfidence ScoreEnd UsersUser-specified Inter-residue DistanceContact MapsI-TASSER ModelingTemplate ProteinsStructure Assembly Simulations
