Journal
/
Génétique
/
Пробоподготовки и анализа данных на основе RNASeq ген выражение данио рерио
Journal JoVE
Génétique
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Génétique
Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Пробоподготовки и анализа данных на основе RNASeq ген выражение данио рерио

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Этот протокол представляет собой подход для анализа всей транскриптом от zebrafish эмбриона, личинки, или сортировка клеток. Мы включать изоляции РНК, путь анализа данных RNASeq и на основе ПЦР qRT Проверка изменения выражения гена.

Tags

Keywords: RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA SequencingBiologie du développementComparative Analysis

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/56187?article_type=v

Параллельное измерение циркадных часов экспрессии генов и гормональную секрецией человека первичных клеточных культур
check_url/fr/56187?article_type=v

Одноклеточный экспрессии генов профилирование с помощью FACS и КПЦР с внутренними стандартами
check_url/fr/56187?article_type=v

Изучение экспрессии генов, регулируемых клеточным циклом, двумя протоколами синхронизации комплементарных ячеек
check_url/fr/56187?article_type=v

Двунаправленная ретровирусная интеграция сайта Методология ПЦР и количественный анализ данных
check_url/fr/56187?article_type=v

Измеряя экспрессии генов в бомбардировке ячменя Aleurone слои с повышенной пропускной способностью
check_url/fr/56187?article_type=v

Метод Optogenetic для контроля и анализа картин выражения гена в ячейке для взаимодействия
check_url/fr/56187?article_type=v

Экдистероидов рецепторов на основе единственного гена переключатель за преднамеренное выражение трансген с надежностью, обратимость и незначительной утечки
check_url/fr/56187?article_type=v

Изучения корня микрофлора: извлечение данных бактериальных сообщества из почвы, ризосфере и корень Endosphere
check_url/fr/56187?article_type=v

Информатики анализ последовательности данных из пакетного дрожжи 2-гибрид экраны
check_url/fr/56187?article_type=v

Сохранение биологических культур и измерения экспрессии генов в nerii тля: Non модель системы для взаимодействия растений насекомое

Read Article