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Transcriptomique cellule unique axée sur le codage à barres de gouttelettes de tissus de mammifères adultes
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Droplet Barcoding-Based Single Cell Transcriptomics of Adult Mammalian Tissues
DOI:

10:12 min

January 10, 2019

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Chapitres

  • 00:04Titre
  • 00:56Dissociating Tissue (Day 1)
  • 03:46Isolating Viable and Healthy Cells (Day 1)
  • 04:46GEM (Gel Bead in Emulsion) Generation and Barcoding (Day 1)
  • 06:17NCBI’s GEO and SRA Submissions
  • 07:34Results: Bioinformatics Analysis of Single Cell Transcriptomics
  • 09:35Conclusion

Summary

Traduction automatique

Ce protocole décrit les processus générales et contrôle qualité vérifie nécessaire pour la préparation de cellules unique chez les mammifères adultes saines pour les préparations de RNA-Seq cellule unique axée sur la gouttelette, haut débit. Séquençage des paramètres, l’alignement de lecture et l’analyse bioinformatique de cellule unique en aval sont également fournis.

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