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Test di immunoprecipitazione dell'RNA metilato per studiare m5C Modifica in Arabidopsis
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Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m5C Modification in Arabidopsis
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Test di immunoprecipitazione dell'RNA metilato per studiare m5C Modifica in Arabidopsis

DOI:
10.3791/61231-v

•

08:50 min

•

May 14, 2020

•

, , ,
1Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, 2Department of Molecular Medicine, Medical School,University of Padua, 3Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Paris, France

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:32RNA Preparation
  • 03:44Methylated RNA Immunoprecipitation (MeRIP)
  • 07:02Results: Representative MeRIP Analyses
  • 08:23Conclusion

Summary

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Il saggio di immunoprecipitazione dell'RNA metilato è un metodo a base di anticorpi utilizzato per arricchire i frammenti di RNA metilati. Accoppiato con il sequenziamento profondo, porta all'identificazione di trascrizioni che trasportano la modifica m5C.

Tags

Methylated RNA ImmunoprecipitationMeRIPRNA ModificationTranscriptomeArabidopsisRNA ExtractionGuanidine ThiocyanateAcid Phenol1-bromo-3-chloropropaneIsopropanolSodium AcetateEthanolDNaseRNA Integrity NumberIn Vitro TranscriptSonication

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