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Secuenciación de ARN-Secuenciación de ARN-Captura láser para Análisis de Expresión Genética Espacial y Temporal Específica de Tejidos en Plantas
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Journal JoVE Biologie
Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants
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Secuenciación de ARN-Secuenciación de ARN-Captura láser para Análisis de Expresión Genética Espacial y Temporal Específica de Tejidos en Plantas

DOI:
10.3791/61517-v

•

08:33 min

•

August 05, 2020

•

, , , , ,
1Department of Animal, Plant and Soil Science, AgriBio Building,La Trobe University, 2Australian Research Council Centre of Excellence in Plant Energy Biology,La Trobe University, 3Australian Research Council Research Hub for Medicinal Agriculture, AgriBio Building,La Trobe University

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:11Tissue Fixation
  • 01:47Tissue Processing
  • 02:38Paraffin Embedding
  • 03:21Polyethylene Naphthalate (PEN) Membrane Slide Preparation
  • 03:49Sectioning
  • 04:53Laser-Capture Microdissection (LCM)
  • 06:14Results: Representative LCM Sample Acquisition and RNA Quantification
  • 07:52Conclusion

Summary

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Aquí se presenta un protocolo para la microdisección de captura láser (LCM) de tejidos vegetales. LCM es una técnica microscópica para aislar áreas de tejido de una manera libre de contaminación. El procedimiento incluye fijación de tejido, incrustación de parafina, seccionamiento, LCM y extracción de ARN. El ARN se utiliza en el análisis de transcriptomas de transcriptomas específicos del tejido aguas abajo y resueltos temporalmente.

Tags

Laser-capture MicrodissectionRNA-sequencingSpatial TranscriptomeTemporal TranscriptomePlant CellsParaffin EmbeddingBarley SeedVacuum InfiltrationDehydrationXyleneParaffin Infiltration

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