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Flujo de trabajo de proteómica cuantitativa utilizando la detección basada en el monitoreo de reacciones múltiples de proteínas del tejido cerebral humano
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Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue
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Flujo de trabajo de proteómica cuantitativa utilizando la detección basada en el monitoreo de reacciones múltiples de proteínas del tejido cerebral humano

DOI:
10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

, ,
1Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, 2Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:49Protein Extraction from Brain Tissue
  • 02:04Protein Quantification and Quality Check
  • 02:32Protein Digestion
  • 03:58Desalting and Peptide Quantification
  • 05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
  • 07:30LC Parameters
  • 08:03MS Parameters
  • 08:25Run Sequence and Instrument QC
  • 09:08Method Refinement
  • 10:58Results and Conclusions

Summary

Traduction automatique

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El protocolo tiene como objetivo introducir el uso de un espectrómetro de masas de triple cuadrupolo para el monitoreo de reacción múltiple (MRM) de proteínas de muestras clínicas. Hemos proporcionado un flujo de trabajo sistemático desde la preparación de muestras hasta el análisis de datos para muestras clínicas con todas las precauciones necesarias a tomar.

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Keywords: Quantitative ProteomicsMultiple Reaction MonitoringTargeted ProteomicsProtein DetectionSample PreparationProtein ExtractionProtein DigestionPeptide CleanupMass Spectrometry

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