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Flux de travail protéomique quantitative utilisant la détection basée sur la surveillance des réactions multiples des protéines du tissu cérébral humain
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Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue
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Flux de travail protéomique quantitative utilisant la détection basée sur la surveillance des réactions multiples des protéines du tissu cérébral humain

DOI:
10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

, ,
1Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, 2Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:49Protein Extraction from Brain Tissue
  • 02:04Protein Quantification and Quality Check
  • 02:32Protein Digestion
  • 03:58Desalting and Peptide Quantification
  • 05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
  • 07:30LC Parameters
  • 08:03MS Parameters
  • 08:25Run Sequence and Instrument QC
  • 09:08Method Refinement
  • 10:58Results and Conclusions

Summary

Traduction automatique

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Le protocole vise à introduire l’utilisation d’un spectromètre de masse triple quadripolaire pour la surveillance des réactions multiples (MRM) des protéines provenant d’échantillons cliniques. Nous avons fourni un flux de travail systématique allant de la préparation des échantillons à l’analyse des données pour les échantillons cliniques avec toutes les précautions nécessaires à prendre.

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Keywords: Quantitative ProteomicsMultiple Reaction MonitoringTargeted ProteomicsProtein DetectionSample PreparationProtein ExtractionProtein DigestionPeptide CleanupMass Spectrometry

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