यहां, हम कम्प्यूटेशनल उपकरणों और विधियों का वर्णन करते हैं जो अक्षीय बढ़ाव और विभाजन के संदर्भ में माउस भ्रूण के तीन और चार आयामी छवि डेटा के विज़ुअलाइज़ेशन और विश्लेषण की अनुमति देते हैं, टोटो ऑप्टिकल प्रोजेक्शन टोमोग्राफी में प्राप्त किया जाता है, और मल्टीफोटॉन माइक्रोस्कोपी का उपयोग करके लाइव इमेजिंग और पूरे-माउंट इम्युनोफ्लोरेसेंस स्टेनिंग द्वारा।