Journal
/
Biochimie
/
Hagle proteomics prøvebehandling automatisert av en åpen kildekode lab robot
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot

Hagle proteomics prøvebehandling automatisert av en åpen kildekode lab robot

DOI:
10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

, , , ,
1Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 2Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 3Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
  • 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
  • 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
  • 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
  • 09:44Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Detaljert protokoll og tre Python-skript er gitt for å betjene et åpen kildekode robotisert væskehåndteringssystem for å utføre halvautomatisk proteinprøvepreparering for massespektrometriforsøk, som dekker fjerning av vaskemiddel, protein fordøyelse og peptidavsaltingstrinn.

Tags

Shotgun ProteomicsAutomated Sample ProcessingOpen-source Lab RobotLiquid Handling SystemMass SpectrometryProtein BiochemistryProteomic StudiesAmmonium BicarbonateDTTTemperature ControlAutomationOpen-source Python Scripts

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/63092?article_type=v

Automatisert Acoustic Doserings for serie Fortynning av Peptide agonister i Potens Fastsettelse Analyser
check_url/fr/63092?article_type=v

LERLIC-MS / MS for inngående karakterisering og kvantifisering av glutamin og asparagin Deamidering i hagle Proteomics
check_url/fr/63092?article_type=v

Kalibrering-fri In Vitro kvantifisering av Protein Homo-oligomerization med kommersielle instrumentering og gratis, åpen kildekode lysstyrke analyseprogramvare
check_url/fr/63092?article_type=v

Utarbeidelse av Chloroplast sub deler fra Arabidopsis for analyse av Protein lokalisering av Immunoblotting eller Proteomikk
check_url/fr/63092?article_type=v

Påvisning av protein ubiquitination nettsteder av peptid berikelse og masse spektrometri
check_url/fr/63092?article_type=v

Ved hjelp av Open-Source MALDI TOF-MS IDBac rørledning for analyse av mikrobiell protein og spesialiserte metabolitten data
check_url/fr/63092?article_type=v

En alt-i-ett sample holder for makro molekylære X-ray Crystallography med minimal bakgrunn spredning
check_url/fr/63092?article_type=v

En plasmaprøve forberedelse for massespektrometri ved hjelp av en automatisert arbeidsstasjon
check_url/fr/63092?article_type=v

TMT Prøve forberedelse for proteomics facility innsending og påfølgende dataanalyse
check_url/fr/63092?article_type=v

Foreta presise og nøyaktige FRET-målinger med ett molekyl ved hjelp av åpen kildekode-smfBox

Read Article