Journal
/
/
Segmentação Baseada em Deep Learning de Tomogramas de Crio-Elétrons
Journal JoVE
Biologie
This content is Free Access.
Journal JoVE Biologie
Deep Learning-Based Segmentation of Cryo-Electron Tomograms
DOI:

10:25 min

November 11, 2022

, , , , ,

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:45Image Import and Preprocessing
  • 02:45Creating Training Data
  • 05:13Using the Segmentation Wizard for Iterative Training
  • 06:52Apply the Network
  • 07:36Segmentation Manipulation and Cleanup
  • 08:16Results: Analysis of the Tomogram of DIV 5 Hippocampal Rat Neuron
  • 09:40Conclusion

Summary

Traduction automatique

Este é um método para treinar um U-Net multi-fatia para segmentação multiclasse de tomogramas crio-elétrons usando uma porção de um tomograma como entrada de treinamento. Descrevemos como inferir essa rede para outros tomogramas e como extrair segmentações para análises posteriores, como a média do subtomograma e o rastreamento de filamentos.

Vidéos Connexes

Read Article