Journal
/
/
Dyp læring-basert segmentering av kryo-elektrontomogrammer
Journal JoVE
Biologie
This content is Free Access.
Journal JoVE Biologie
Deep Learning-Based Segmentation of Cryo-Electron Tomograms
DOI:

10:25 min

November 11, 2022

, , , , ,

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 00:45Image Import and Preprocessing
  • 02:45Creating Training Data
  • 05:13Using the Segmentation Wizard for Iterative Training
  • 06:52Apply the Network
  • 07:36Segmentation Manipulation and Cleanup
  • 08:16Results: Analysis of the Tomogram of DIV 5 Hippocampal Rat Neuron
  • 09:40Conclusion

Summary

Traduction automatique

Dette er en metode for å trene et flerskive U-Net for multi-klasse segmentering av kryo-elektrontomogrammer ved å bruke en del av ett tomogram som treningsinngang. Vi beskriver hvordan man utleder dette nettverket til andre tomogrammer og hvordan man trekker ut segmenteringer for videre analyser, for eksempel subtomogramgjennomsnitt og filamentsporing.

Vidéos Connexes

Read Article