Крио-STEM-томография позволяет визуализировать органеллы интактных клеток без встраивания, сечения или других инвазивных препаратов. Полученное 3D-разрешение в настоящее время находится в диапазоне нескольких нанометров, с полем зрения в несколько микрометров и доступной толщиной порядка 1 мкм.