Imaging behavior and neural activity over long time scales without immobilization of the animal is a prerequisite to understand behavior. Agarose microfluidic chambers imaging (AMI) can be used to image neural activity and behavior for all life stages of Caenorhabditis elegans.
動作は、神経系によって制御されます。カルシウムイメージングは、さまざまな動作中のニューロンの活性を測定するための透明な線虫、線虫(Caenorhabditis elegans)における直接的な方法です。行動と神経活動を相関させるために、動物は、固定化されるべきではないが、移動することができる必要があります。多くの行動の変化は、長い時間スケールの間に発生し、行動の多くの時間にわたって記録が必要です。これは、食品の存在下で虫を培養することが必要になります。どのようにワームは、培養され、それらの神経活動は、長い時間スケールにわたって撮像されたことができますか?アガロースマイクロチャンバーイメージング(AMI)は、以前の文化に開発され、小さな幼虫を観察し、今Cの成虫段階まで初期のL1からのすべてのライフステージを研究するために適応されていますましたエレガンス 。 AMIは、Cの様々なライフステージで実行することができますエレガンス 。長期カルシウムイメージングは、COM短い外部トリガ露光を用いて、動物を固定化することなく達成されます電荷結合素子(EMCCD)カメラの記録を電子増倍とbined。ズームアウトやスキャンが並列に40ワームまでのイメージにこの方法をスケールアップすることができます。したがって、この方法は、Cのすべてのライフステージに長い時間スケールにわたって画像の行動と神経活動に記載されていますエレガンス 。
Caenorhabditis elegans has been established as a model system to study behavior1. Due to its amenability to genetics, the molecular and cellular mechanisms underlying behavior can be studied. Many behaviors occur on long time scales. Two principal approaches can be used to observe motile animals over long time scales. The first approach is following the animal during movement using an automated stage or camera2-8 and the second is to restrict the movement to a range that is at least as small as the field of view of the camera9-14. Both methods have their advantages. Tracking allows following an animal over long spatial ranges but limits the number of animals that can be discerned in one experiment. Restricting the movement of the animals allows scaling up the observation to many individuals at the same time by using arrays of restricted compartments.
Because the nematode is transparent, live fluorescent imaging can be performed non-invasively15. Calcium imaging provides a functional readout for the activity of excitable cells and is established for C. elegans16-20. Calcium enters the cell via channels in the plasma membrane that open upon depolarization. Thus, calcium acts as a proxy for neural activity. Calcium sensors can be grouped in two major classes, ratiometric and non-ratiometric sensors. Both classes employ conformational changes of calcium-binding proteins induced upon binding of calcium. Ratiometric sensors contain two fluorescent proteins. When the lower-wavelength fluorescent protein is excited, a part of the light energy is transmitted to the higher wavelength fluorescent protein as a function of their distance in a process called Fluorescence Resonance Energy Transfer or Förster Resonance Energy Transfer (FRET)21. Non-ratiometric sensors are based on circularly permuted GFP and employ de-quenching of the fluorophore caused by calcium binding22. Each class has its advantages. While ratiometric sensors are less sensitive to movement or expression artifacts, non-ratiometric sensors typically have a higher dynamic range. Both ratiometric and non-ratiometric sensors have been useful to study the activity of excitable cells in C. elegans16-20,23,24.
When doing long-term fluorescence imaging, the experimenter will have to deal with several potential challenges: 1. Disturbance of behavior through excitation light: Worms are sensitive to short-wavelength fluorescence excitation light and avoid light from the violet to blue range that is used for calcium imaging25,26. Worms respond with either a backward or a forward escape response25,26. Thus, the amount of light needs to be controlled. 2. Bleaching of the fluorescent sensor protein: Often, bleaching of the fluorescent protein hampers long-term imaging. Typically, however, light intensities that are needed to observe bleaching are higher than the light intensities that cause disturbing effects on the behavior of the animals. Thus, bleaching is only a theoretical problem in this type of calcium imaging. 3. Worms inside the microchambers are not fixed and move constantly during wake behavior and images may appear blurred if the worm is not immobilized. All these challenges can be solved using extremely short exposure times with low light intensity. This can be realized by using a highly sensitive EMCCD camera with short exposure times and external triggering of a light emitting diode (LED). To expose the worms to the illumination light as briefly as possible (only during the exposure time of the camera) the LED is externally triggered using a transistor-transistor logic (TTL) signal that the camera emits during exposure resulting in an illumination of the worm for precisely the time the camera chip is exposed. This also means that the EMCCD chip will be dark during data readout, which is optimal for readout performance of this chip.
Previously, agarose microchambers have been developed for long-term fluorescence imaging of C. elegans larvae9. Here, it is described how agarose micro-chambers can be used for long-term calcium imaging for any life stage of C. elegans, how calcium imaging can be performed, and how this method can be upscaled to assay many individual worms in parallel.
ハードウェア
顕微鏡の焦点は、典型的には、長期の画像取得中にドリフトします。複合顕微鏡は、フォーカス保持システムは、主要な顕微鏡メーカーから購入することができます。フォーカス制御との複合顕微鏡はあまりにpricyである場合には、単純な代替案は、実体顕微鏡を使用することです。複合顕微鏡は、高開口数(NA)を有する対物レンズを使用することができ、容易に自動化することができます。 40X油の目標は非常に適しています。水浸レンズがあるため、長期的な撮影時の蒸発の理想的ではありません。微分干渉コントラスト(DIC)は、形態学的および行動の変化に追従するのを助ける素晴らしいコントラストを生成する、単純な明視野イメージングを使用することもできます。 DICまたは明視野イメージングでは、顕微鏡のDIA-照明経路に赤色光フィルタを配置することにより、赤色光を使用しています。いくつかのマイクロチャンバーのスキャンのために自動化されたステージが必要です。最高のパフォーマンスは、ACですステージが使用される場合、非線形加速と減速があり、スキャン中の動物を乱す防ぐために低い走査速度を設定することができるhieved。私たちは、遅いスキャンが実際にワーム(データは示していない)の機械受容システムを活性化しないことを示唆し、スキャン中機械受容ニューロン(ALMおよびPLM)で行動反応やカルシウム増加を観察していません。市販のLEDのシステムを使用することができます。いくつかの企業は、異なる波長のLEDを含む、すぐに使用できるソリューションを提供しています。 LEDは、外部TTL信号でLEDをトリガーするオプションを持っている必要があります。高感度カメラは、動物の移動のカルシウムイメージングのために必要とされます。 EMCCDカメラは、市場で最も敏感なカメラです。カメラは露光中TTL出力(とも呼ばれる "火"の出力)を持っている必要があります。蓋ヒータは倒立顕微鏡を使用している場合は、蓋上の凝縮を防止するために必要とされます。正立顕微鏡で、料理は蓋のWiなるように配置されます底にできるでしょうので、結露を防止されていて、蓋加熱が必要とされません。蓋は、長期の撮像中の水の蒸発を防ぐために、皿を閉じてしっかりとすべきです。
PDMSスタンプ
アガロースを成形するための構造を含むPDMSスタンプの表面を離れてPDMSスタンプをサポートしてスライドガラスから直面しています。カスタムマイクロ流体チップを提供する企業とのリストは、ウィキペディア(で見つけることができるhttp://en.wikipedia.org/wiki/List_of_microfluidics_related_companies )。
その室に線虫を充填
これはプロトコルの中で最も重要なステップであり、以下の点を考慮すべきである:A)アガロースのしっとり感がワームを転送すると、画像化のために重要です。アガロースがあまりにも湿っている場合、 すなわち、液体COVがあります液体は細菌が離れて流れるようになりますので、複数のマイクロチャンバーの面積をering、それは制御された方法で、細菌の食品やワームを配布することはできません。アガロースは乾燥しすぎている場合には、細菌やワームが増加力は容易にアガロースへの損傷を引き起こすワームや細菌を削除するために使用する必要があることを意味しやすいピックを降りないことがあります。ワームの多くに充填する際に、アガロースは干上がることがあります。最悪の場合、アガロースは、チャンバが崩壊する最終的にはそのように乾燥していることになります。アガロースは乾燥しすぎている場合それは虫が存在しないチップの側にS-基礎の小滴(約2μl)を配置することによって再水和することができます。その後、白金線を浸漬液にピックアップしてもチャンバがワームが充填されている領域への液体の一部を引き出します。 B)食物の量は、成功した長期的なイメージングのために重要です。十分な食料がない場合、ワームは、それが不足することがあります。過剰な食べ物は、チャンバの空洞がある場合液体のようではなく、固体のように動作しませんし、ワームは細菌をオフに押すことによって、チャンバから脱出することができます。全室を埋める細菌懸濁液を得ることを目指しています。ワームは、実験中、それらの長さの大部分に沿って寒天とガラス表面と一定の物理的に接触しているとクロールの動作は、プレートの動きに類似して、液体中にスラッシングとは異なるように思われます。アガロースの損傷機械C)は、実験を台無しにすることができます。細かいピックは不可欠です。それは鋭い角を持つべきではありません。ピペットの先端に取り付けられた柔らかいまつげ白金ピックを使用する代わりに、チャンバに細菌や寄生虫を移動させるために使用することができます。しかし、ほとんどの場合、過乾燥アガロース損傷の原因です。ピックやまつげは、理想的には、かろうじてアガロース自体に触れる必要があり、アガロース表面上の水膜は、ワームや細菌をやってのけるする必要があります。チャンバを密閉すると、再び、アガロースの水分が不可欠です。そこにはないはずこれはシールの間に細菌や虫を洗い流すことができるので、アガロース表面上の任意の遊離液体です。大きな気泡を穏やか寒天平板の角を持ち上げることにより除去することができます。室よりも小さい小さい泡は、多くの場合、室内の閉じ込められてしまいます。これらの気泡は問題ではなく、吸収によって消えます。料理を組み立てた後、アガロースは乾燥しすぎたり、あまりにも濡れていないことを再度確認してください。チャンバはうまく密封されるべきであり、室間に液体の任意の流れがあってはなりません。アガロースがあまりにも濡れている場合は、室は適切に密封されません。ワームは逃げることができるか、その食品が洗い流されます。サンプルがあまりにも湿っている場合は、単純なふたを開けて、1~2分のためのアガロース乾燥させます。アガロースは乾燥しすぎている場合は、室が崩壊することができ、ワームは、エスケープします。
ズームアウトすることによってスケールアップ
蛍光イメージングの場合、ズームアウトは、より低い倍率で得られる光の量が少ないことによって制限されます。また、EMCCDカメラは感度に最適化されており、多くの場合、比較的低い解像度を持っています。しかし、イメージング4倍スケールアップすることも可能です。 140X(20X目的と0.7Xのカメラマウントを使用することによって達成)拡大率および512×512ピクセル、8×8ミリカメラを使用した場合、例えば、190ミクロンのx 190ミクロンの4つのチャンバは、1フレームに収まることができます。 (例えば、sCMOSカメラ、16.6ミリメートル×14ミリメートルチップ、2560 X 2560ピクセル= 5.5メガピクセルのような)大きなチップを搭載した高解像度カメラは、DICと明視野画像のアップスケーリングに最適化します。 100倍の倍率を使用している場合例えば、190ミクロンのx 190μmのチャンバ内の最大30のL1ワームは、このカメラの各フレームに収まることができます( 図3参照 )。原理的には、ズームアウト、スキャンはまた、動物のより大きな数を得るために組み合わせることができます。唯一の焦点面を撮像する必要があるように、ほとんどのニューロンは、焦点に非常によくご利用いただけます。ニューロンは、圧電駆動を用いてスキャンをAZ、焦点の外に移動することがわかっている場合、各時刻pで撮影することができOINT。
別の行動への適応
このプロトコルは、長い時間スケール全体の挙動の良いアイデアを提供します。明らかに、バーストのタイミングが異なる挙動及びライフステージに適応する必要があります。
技術の限界
いくつかの要因が撮影の期間を制限します。最も重要なのは、食物の量です。食物が消費されると、幼虫は開発停止します。このように、小室に(190 X 190μm)のワームは、L3段階まで開発し、逮捕します。長い撮像時間が必要な場合は、より大きなチャンバを使用しなければなりません。 3日 – 長期イメージングの最大持続時間は、2.5の範囲です。より長い撮影が必要な場合、ワームを回収し、新しいチャンバ内に配置する必要があります。成虫を画像化すると、別の制限は、これらのワームの子孫によって引き起こされます。成虫は幼虫孵化から卵を産みます。これらの幼虫は、チャンバの内部にとどまります、食品を消費し、画像解析を妨害することができます。子孫が問題である場合、溶液は、滅菌成人を使用するか、または新鮮なチャンバにワームを繰り返し配置することです。ワームを回復するには、チャンバを含むアガローススラブがメスで自由に切断され、カバーガラスをオフに引っ張られて、ワームを回収することが可能なNGMプレート上に置かれます。別の制限は、比較的小さな領域にワームの制限です。長距離移動が分析される必要がある場合、これは問題となり得ます。チャンバ内の動物は機械的およびoptogenetically 21,27,34,35刺激することができるが、チャンバの密封された性質は、それが困難な可溶性または揮発性の刺激を適用することになります。例えば、酸素または二酸化炭素のような生物学的に重要なガスが寒天中に自由に拡散することができます。皿に大きな空気タンクは、実験に必要な時間にわたって一定のチャンバー内のガス濃度を維持する必要があります。しかし、地元の酸素concentratioことを心に留めておくべきですnはチャンバ内に複数のプレート上での培養よりも液体培養で見られる条件に類似していてもよいです。
既存の方法に対する意義
マイクロ流体デバイスは、非常にCで勉強し、行動と発達の進んでいますエレガンス 。多くの場合、マイクロ流体構造は、PDMS 12で作られています。ここでは、アガロースから製造されたマイクロ流体文化室を生成するためのプロトコルについて説明します。この技法の強度が高い結像品質、生理学的測定、長期的画像化、および適度に高スループットでの挙動との相関の組み合わせです。高画質、高NA対物レンズを用いて、ガラスカバースリップを介して撮像することにより達成されます。その結果、細胞内構造のカルシウムイメージング、共焦点イメージングのような蛍光撮像を行うことができます。動物は、他のシステムのように固定化されていないので、それは生理的な測定値と挙動との相関を可能にします。ベックause動物は十分な食べ物を持って、彼らは長期的なイメージングを可能にする開発を継続します。動物がその定義された室に制限されているため、このシステムは、1つの実行で画像多くのワームをすることができます。したがって、この方法は、容易に9,27,34-36をスケールアップすることができます。
将来の応用
これまでのところ、このシステムは、Cに睡眠行動を研究するために主に使用されていますエレガンスのL1幼虫。しかし、全てのステージへの適応は、それが可能dauersと大人でも行動の広い範囲を勉強するようになります。行動の広い配列は、相手から産卵に至るまで、この技術を用いて研究することができます。
The authors have nothing to disclose.
HBのマックス·プランク研究所とゲッティンゲン大学院ジュニアグループの奨学金は、この作業に資金を供給しました。
high-melting point agarose | Fisher Bioreagents | BP(E)164-1000 | |
Top Vision Low Melting Point Agarose | Thermo Scientific | R0801 | |
LED system | CoolLED | pE-2 | |
compound microscope | Nikon | TiE | |
stereomicroscope | Leica | M5 | |
EMCCD camera | Andor | iXon 897 | now sold as iXon Ultra 897 |
sCMOS camera | Andor | Neo | |
plasma cleaner | Harrick | PDC-23G2 | |
lid heater | MPI workshop | custom made | |
plastic dish | Falcon | 08-757-100A | |
z-stage for the microscope | Prior | Nano Scan Z | |
x-y-stage for the microscope | Prior | Proscan III | |
PDMS stamp | Abbott Laboratories | custom made | |
red light filter | Chroma | ET660/50m | |
35mm petri dish | Falcon | Falcon Disposable Petri Dishes, Sterile, Corning | |
double sided sticky tape | Sellotape/Henkel | double sided 12mm x 33 m | alternatively Advance double sided sticky tape from Rubance Adhesives can be used. |