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I cambiamenti nella velocità e nella distribuzione del flusso sanguigno sono fondamentali per mantenere la perfusione di tessuti e organi in risposta a diverse esigenze cellulari. Inoltre, la comparsa di difetti nella microcircolazione può essere un indicatore primario nello sviluppo di più patologie. I progressi nell'imaging ottico hanno reso la microscopia intravitale (IVM) un approccio pratico, permettendo l'imaging a livello cellulare e subcellulare negli animali vivi ad alta velocità nel tempo. Tuttavia, nonostante l'importanza di mantenere un'adeguata perfusione dei tessuti, la variabilità spaziale e temporale nel flusso capillare è raramente documentata. Nell'approccio standard, un piccolo numero di segmenti capillari viene scelto per l'imaging in un periodo di tempo limitato. Per quantificare in modo completo il flusso capillare in modo imparziale, abbiamo sviluppato Spatial Temporal Analysis of Fieldwise Flow (STAFF), una macro per il software di analisi delle immagini open source FIJI. Utilizzando sequenze di immagini ad alta velocità di campi completi del flusso sanguigno all'interno dei capillari, STAFF produce immagini che rappresentano il movimento nel tempo chiamate kymographs per ogni intervallo di tempo per ogni segmento vascolare. Dai kymographs STAFF calcola le velocità dalla distanza di spostamento dei globuli rossi nel tempo e restituisce i dati sulla velocità come una sequenza di mappe spaziali codificate a colori per la visualizzazione e l'output tabulare per le analisi quantitative. Nei normali fegati di topo, STAFF analizza profonde differenze di velocità di flusso tra le regioni pericentrali e periportali all'interno dei lobuli. Ancora più inaspettate sono le differenze di velocità di flusso osservate tra i sinusoidi che sono affiancati e le fluttuazioni osservate all'interno di singoli segmenti vascolari nel corso dei secondi. STAFF è un nuovo potente strumento in grado di fornire nuove intuizioni consentendo la misurazione delle complesse dinamiche spatiotemporali del flusso capillare.