È richiesta un abbonamento a JoVE per visualizzare questo contenuto. Accedi o inizia la tua prova gratuita.

Articolo metodologico

Approccio sistematico per identificare nuove molecole antimicrobiche e antibiofilm dagli estratti e dalle frazioni delle piante per prevenire la carie dentale

6K visualizzazioni

⸱

DOI:

10.3791/61773

⸱

31 marzo 2021

 ,  ,  ,  ,  , 

* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

I prodotti naturali rappresentano punti di partenza promettenti per lo sviluppo di nuovi farmaci e agenti terapeutici. Tuttavia, a causa dell'elevata diversità chimica, trovare nuovi composti terapeutici dalle piante è un compito impegnativo e dispendioso in termini di tempo. Descriviamo un approccio semplificato per identificare molecole antimicrobiche e antibiofilm da estratti e frazioni vegetali.

Abstract

I prodotti naturali forniscono sostanze strutturalmente diverse, con una miriade di attività biologiche. Tuttavia, l'identificazione e l'isolamento dei composti attivi dalle piante sono impegnativi a causa della complessa matrice vegetale e delle lunghe procedure di isolamento e identificazione. Pertanto, viene presentato un approccio graduale per lo screening dei composti naturali dalle piante, incluso l'isolamento e l'identificazione di molecole potenzialmente attive. Comprende la raccolta del materiale vegetale; preparazione e frazionamento di estratti grezzi; approcci cromatografici e spettrometrici (UHPLC-DAD-HRMS e NMR) per l'analisi e l'identificazione dei composti; test biometrici (attività antimicrobiche e antibiofilm; "forza di adesione" batterica al pellicolo salivare e matrice di glucano iniziale trattata con trattamenti selezionati); analisi dei dati. Il modello è semplice, riproducibile e consente lo screening ad alta produttività di più composti, concentrazioni e fasi di trattamento che possono essere controllati in modo coerente. I dati ottenuti forniscono le basi per studi futuri, tra cui formulazioni con gli estratti e/o frazioni più attivi, isolamento delle molecole, modellazione di molecole a target specifici in cellule microbiche e biofilm. Ad esempio, un obiettivo per controllare il biofilm cariogenico è quello di inibire l'attività dello Streptococcus mutans glucosyltransferasi che sintetizzano i glucani della matrice extracellulare. L'inibizione di questi enzimi impedisce l'accumulo di biofilm, diminuendone la virulenza.

Introduzione

I primi modelli di medicina utilizzati nelle società erano basati su prodotti naturali (NP). Da allora, gli esseri umani sono alla ricerca di nuove sostanze chimiche in natura che possono essere trasformate infarmaci 1. Questa ricerca ha causato un miglioramento continuo delle tecnologie e dei metodi per lo screening etnobotanico1,2,3. I PNP offrono una ricca fonte di sostanze strutturalmente diverse, con una vasta gamma di attività biologiche utili per lo sviluppo di terapie alternative o adiuvanti. Tuttavia, la matrice vegetale complessa intrinseca r....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Protocollo

1. Raccolta di materiale vegetale

  1. Materiale vegetale
    1. Registrare l'accesso al materiale vegetale su piattaforme elettroniche che regolano l'accesso al patrimonio genetico nel paese in cui si svolgerà la raccolta. Ad esempio, in Brasile, registrati al Sistema Nazionale per la Gestione del Patrimonio Genetico e delle Conoscenze Tradizionali Associate - SisGen (sito web https://sisgen.gov.br/paginas/login.aspx).
    2. Raccogliere campioni del materiale vegetale di interesse (ad esempio, foglie, steli, radici, fiori, frutti). Registrare se il materiale è stato raccolto durante la fase riproduttiva o vegetativa.
    3. Registrare i parametri di ra....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Risultati

Forniamo un esempio di utilizzo di un approccio sistematico per migliorare l'attività biologica degli estratti vegetali e delle frazioni per identificare molecole potenzialmente attive per possibili nuove terapie anti-carie: attività antimicrobiche e antibiofilm degli estratti di Casearia sylvestris da distinti biomi brasiliani contro Streptococcus mutans e Candida albicans13.

Priorità bassa
Interazioni complesse tra specif.......

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Discussione

Le principali sfide legate al lavoro con estratti grezzi naturali comprendono la loro composizione complessa e le inadeguatezze dei classici studi di isolamento bioguidato. Sebbene questo processo sia lento, è efficace e ha portato a importanti risultati nella ricerca NP. Per razionalizzare, sono necessari studi basati sulla definizione delle priorità per razionalizzare. Pertanto, l'uso di moderni approcci di profilazione chimica per l'analisi del CE e della dereplicazione prima dell'isolamento è importante per caratteri.......

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Dichiarazioni

Nessun conflitto di interessi dichiarato.

Ringraziamenti

Esprimiamo la nostra gratitudine a Núcleo de Bioensaios, Biossíntese ed Ecofisiologia de Produtos Naturais (NuBBE) dell'Istituto di Chimica dell'UNESP, Araraquara/SP per aver fornito i laboratori per la preparazione del materiale vegetale. Ringraziamo anche il Laboratorio di Microbiologia Applicata del Dipartimento di Materiali Dentali e Protesi, UNESP, Araraquara/SP. Questa ricerca è stata sostenuta da una sovvenzione di ricerca della São Paulo Research Foundation (FAPESP #2013/07600-3 all'AJC) e da borse di studio più fondi generali (FAPESP #2017/07408-6 e FAPESP #2019/23175-7 alla SMR; #2011/21440-3 e #2012/21921-4 al PCPB). Il Consiglio nazionale per lo sviluppo s....

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Micropiastre a 96 pozzetti KasviFondo piatto
Carbone attivoLABSYNTHFase
Mulino analiticoIka LabortechniKModello A11 Base
Piastre di agar per sangueLaborclin
Colonna cromatografica C18Phenomenex Kinetex150 &volte; 2,1 mm, 2,6 &; m, 100Â
Dimetilsolfossido Sigma-AldrichSoluzione
Lettore di piastre ELISABiochrom Ez
EtanoloJ. T. BakerPer le fasi di estrazione e frazionamento e la composizione
EtanoloSigma-AldrichSoluzione
Acetato di etileJ. T. BakerFase
GraphPad SoftwareLa JollaGraphPad Prism7
HexaneJ. T. BakerFase di
IncubatoreThermo Scientific
IsopropanoloJ. T. BakerPer la fase
Liofilizzatore (un liofilizzatore)SavantModulyo
Nylon MilliporeLAC0.22 &; m x 13 mm
Agitatore orbitaleQuimisModello G816  Cartuccia di
Macherey-NagelFase di pulizia e/o frazionamento
Gel di siliceMerck40– 63&sottile; μ m, 60&magre; â
Cloruro di sodio (NaCl)Synth0,89% in acqua
Cartucce di estrazione in fase solida (SPE)Macherey-NagelFase
TriptoneDifco
UHPLC-DADDionexUltimate 3000 RS
Bagno ad ultrasuoniUNIQUEModello USC 2800
Estratto di lievitoDifco
di pulizia e/o frazionamentoper veicolidella fase mobileper veicolidi frazionamentofrazionamentodi estrazione estrazione in fase solida in poliammide M20 di pulizia e/o frazionamento

Riferimenti

  1. Newman, D. J., Cragg, G. M. Natural Products as Sources of New Drugs over the Nearly Four Decades from 01/1981 to 09/2019. Journal of Natural Products. 83 (3), 770-803 (2020).
  2. Wolfender, J. L., Litaudon, M., Touboul, D., Queiroz, E. F.

Accesso limitato. Accedi o avvia una prova gratuita per visualizzare questo contenuto.

Ristampe e permessi

Esplora altri articoli

Attività antimicrobicaattività antibiofilmestratti vegetaliestrazione in fase solidaUHPLC-DAD-HRMSanalisi NMRStreptococcus mutanspellicola salivarematrice di glucanoinibizione del biofilm