Her beskriver vi en protokol til den automatiserede segmentering af fluorescently mærket væv på dias ved hjælp af en widefield høj-indhold analysesystem (WHCAS). Denne protokol har omfattende programmer på ethvert område, der involverer kvantitering af fluorescerende markører i biologisk væv, herunder biologiske videnskaber, medicinsk teknik og Sundhedsvidenskab.