È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo. Accedi o inizia la tua prova gratuita.
Capitoli
- 00:04Titolo
- 00:50Mapping Fastq Files
- 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
- 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
- 08:01Conclusion
Séquençage en profondeur des populations de levures sélectionnées pour les interactions 2-hybride de levure positive potentiellement donne une mine de renseignements sur les protéines qui interagissent de partenaire. Nous décrivons ici l’exploitation d’outils bioinformatiques précis et à jour de logiciels sur mesure pour analyser les données de séquençage de ces écrans.
Tags
Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads
