John M. Coffin Department of Molecular Biology and Microbiology Tuffts University Biography Publications Institution JoVE Articles John M. Coffin has not added a biography. If you are John M. Coffin and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Eingeschränkte Replikation Von Xenotropic Murine Leukemia Virus-ähnliche Viren in Faserpigtails Makaken Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22238316 Charakterisierung, Zuordnung Und Verteilung Der Beiden Elterlichen XMRV-Proviren Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22031947 Endogene Mauseleukämie Viren: Beziehung Zu XMRV Und Verwandte Sequenzen in Menschliche DNA-Proben Erkannt Advances in Virology. 2011 | Pubmed ID: 22312358 Short Course Combivir Nach Einzel-Dosis Nevirapin Verringert, Aber Nicht Die Entstehung Von Nevirapin Widerstand Bei Frauen Beseitigt Antiviral Therapy. Nov, 2011 | Pubmed ID: 22293443 Binden Von Mehr Als Ein Tva800 Ist Molekül Für ASLV-A-Eintrag Erforderlich Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22099981 Identifizierung, Charakterisierung Und Vergleichende Genomische Verteilung Der HERV-K (HML-2) Gruppe Von Menschlichen Endogene Retroviren Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22067224 Ausfall, XMRV/MLVs Im Blut Von Patienten Mit Chronic Fatigue Syndrom Zu Bestätigen: Eine Multi-laboratory Studie Science (New York, N.Y.). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21940862 Mehrheit Der CD4 + T-Zellen Aus Peripherem Blut Von HIV-1-infizierten Enthalten Nur Ein HIV-DNA-Molekül Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21690402 Rekombinante Ursprung Des Retrovirus XMRV Science (New York, N.Y.). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21628392 Rolle Der Niederfrequenz-HIV-1 Varianten Scheitern Nevirapin-haltigen Antivirale Therapie Bei Frauen, Die Zuvor Einzel-Dosis Nevirapin Ausgesetzt Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2011 | Pubmed ID: 21576473 Schätzung Der Effektiven Rekombination Und Der Durchschnittlichen Rate Auswahl Koeffizient Für HIV in Chronischen Infektion Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21436045 Klonale Sequenzen Von Plasma Von Patienten Mit Residual HIV-1-Virämie Und Intensivierten Antiretroviralen Therapie Erholt Sind Identisch Zur Replikation Von Viralen RNAs Erholte Sich Von Zirkulierenden Ruhende CD4 + T-Zellen Journal of Virology. May, 2011 | Pubmed ID: 21367910 Der Blood Xenotropic Murine Leukemia Virus-Related Virus Wissenschaftliche Forschung Working Group: Mission, Fortschritt Und Pläne Transfusion. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21366602 Genetischer Vielfalt Der Simianes Immundefizienz-Virus-Codierung HIV-1-Reverse-Transkriptase Weiterhin Makaken Trotz Antiretroviraler Therapie Journal of Virology. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21084490 Kontamination Der Menschlichen DNA-Proben Mit Maus Kann DNA Zu Falsche Erkennung Von XMRV-ähnliche Sequenzen Führen Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171973 Maus-DNA-Kontamination Von Menschlichem Gewebe Für XMRV Getestet Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171966 HIV-1 Weiter Zu Replizieren Und Bei Patienten Mit Natürlicher Kontrolle Der HIV-Infektion Zu Entwickeln Journal of Virology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 20926564 Die Wirkung Von Raltegravir Intensivierung Auf Low-Level Verbleibende Virämie Bei HIV-infizierten Patienten Auf Antiretrovirale Therapie: Eine Randomisierte Kontrollierte Studie PLoS Medicine. 2010 | Pubmed ID: 20711481 Muster Des Humanen Immundefizienz-Virus Typ 1 Rekombination Ex Vivo Belegen Für Coadaptation Von Körperregionen, Die Zu Reinigende Auswahl Für Intersubtype Recombinants Zu Während Der Replikation Journal of Virology. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20504919 Vergleich Von Standard PCR/Klonen Zu Einzelnen Genomsequenzierung Zur Analyse Von HIV-1-Populationen Journal of Virological Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20451557 Tumoren Induziert in Den Mäusen Durch Direkte Inokulation Von Plasmid DNA Ausdrücken Beide Aktiviert H-Ras Und C-Myc International Journal of Biological Sciences. 2010 | Pubmed ID: 20376206 Flexibler Einsatz Nuklearer Import Pathways Von HIV-1 Cell Host & Microbe. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20227665 Antiretrovirale Intensivierung Und Valproinsäure Fehlen Nachhaltige Wirkung Auf HIV-1-Virämie Bzw. Ruhelosigkeit Zelle Infektion CD4 + PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20186346 Multisite Anpassung in Anwesenheit Von Selten Rekombination Theoretical Population Biology. May, 2010 | Pubmed ID: 20149814 Niederfrequenz Nonnucleoside Reverse-Transkriptase-Inhibitor-resistente Varianten Beitragen Zum Ausfall Von Efavirenz-haltigen Therapien in Behandlung-erfahrene Patienten The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20102272 Endogene Retroviren Nicht RNA-Virus Elemente Im Säugetier-Genome Nature. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20054395 Optimierung Der Allel-spezifische PCR Mit Patienten-spezifischen HIV Konsens Sequenzen Für Besser Gekleideteres Design Journal of Virological Methods. Mar, 2010 | Pubmed ID: 19948190 RT-SHIV Teilgesamtheit Dynamik in Infizierten Makaken Während Der Anti-HIV-Therapie Retrovirology. 2009 | Pubmed ID: 19889213 Virologie. Ein Neuer Virus Für Alte Krankheiten? Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815721 Persistent Auf Niedriger Ebene Virämie Bei HIV-1-Elite-Controller Und Beziehung Auf Immunologische Parameter The Journal of Infectious Diseases. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19656066 Hoher Wirkungsgrad Von HIV-1 Genomische RNA Verpackung Und Heterozygote Bildung Von Einzelnen Virion Analyse Offenbart Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19628694 Wahrscheinlich Die Rolle Von APOBEC3G-vermittelte G-zu-A-Mutationen Im HIV-1-Evolution Und Droge-Widerstand PLoS Pathogens. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19343218 Atazanavir-Ritonavir Allein Als Erhaltungstherapie Antiretrovirale Therapie Vereinfachung: Endgültige Klinische Und Virologisches Ergebnisse Von 48 Wochen The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19191590 Lytischer Untermodul Laden Von CD8 + T-Zellen Ist Erforderlich Für HIV-infizierte Zelle Beseitigung Immun-Steuerelement Zugeordnet Immunity. Dec, 2008 | Pubmed ID: 19062316 Dämpfung Von Tausend Schnitte The New England Journal of Medicine. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19020330 Host-Retroviren-Wettrüsten: Trimmen Den Haushalt Cell Host & Microbe. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18779045 Auswirkungen Der Retroviren Auf Host-Genom-Funktion Annual Review of Genetics. 2008 | Pubmed ID: 18694346 HIV-1-Rücktranscriptase Verbindung Unterdomäne Mutationen Reduzieren Vorlage RNA-Abbau Und AZT Exzision Verbessern Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18667707 Valproinsäure Ohne Verstärkte Antivirale Therapie Hat Auswirkungen Auf Die Anhaltende HIV-Infektion Von Ruhelosigkeit CD4 + T-Zellen Beschränkt AIDS (London, England). Jun, 2008 | Pubmed ID: 18525258 Wechselwirkungen Von Murinen APOBEC3 Und Menschliche APOBEC3G Mit Mauseleukämie Viren Journal of Virology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18448535 Low-Level Virämie Wird Für Mindestens 7 Jahre Bei Patienten Unter Suppressive Antiretrovirale Therapie Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18332425 Häufige Polymorphismus an Droge-Widerstand-Standorten in HIV-1 Protease Und Reverse Transkriptase AIDS (London, England). Feb, 2008 | Pubmed ID: 18301062 Oncogenicity Von DNA In-vivo: Tumor-Induktion Mit Ausdruck Plasmide Für Aktivierte H-Ras Und C-Myc Biologicals : Journal of the International Association of Biological Standardization. May, 2008 | Pubmed ID: 18218323 Die Rolle Der APOBEC3 Genetische Vielfalt Unter Den Endogenen Mauseleukämie Viren PLoS Genetics. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17967065 Hochregulation Des CTLA-4 Durch HIV-spezifische CD4 + T-Zellen Mit Fortschreiten Der Erkrankung Korreliert Und Definiert Eine Umkehrbare Immune Dysfunktion Nature Immunology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17906628 Unterdrückung Der Virämie Und Evolution Des Humanen Immundefizienz-Virus Typ 1 Medikamentenresistenz in Ein Makaken-Modell Für Die Antiretrovirale Therapie Journal of Virology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17855539 ART Unterdrückt Plasma HIV-1 RNA Zu Einer Stabilen Sollwert Von Pretherapy Virämie Vorhergesagt PLoS Pathogens. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17411338 Mutationen in Der Verbindung-Domäne Des HIV-1-Rücktranscriptase Erhöhen 3'-Azido-3'-Deoxythymidine Widerstand Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2007 | Pubmed ID: 17179211 Verblindeten Multizentrischen Vergleich Der Methoden Zur Erkennung Von Medikamenten-resistenten Mutanten Des Humanen Immundefizienz-Virustyp 1 in Geringer Dichte Journal of Clinical Microbiology. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16825395 Auswahl Und Persistenz Von Nicht-Nukleosid-Reverse-Transkriptase-Inhibitor-resistente HIV-1 in Patienten Starten Und Beenden Von Nicht-Nukleosid-Therapie AIDS (London, England). Mar, 2006 | Pubmed ID: 16514300 Evolution Der Breiten Wirtsbereich in Retroviren Führt Zu Zellentod Von Hoch Zytopathischen Varianten Vermittelt Journal of Virology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16378958 Menschlichen Endogene Retroviren Elemente Als Indikatoren Der Ektopische Rekombination Ereignisse in Das Genom Der Primaten Genetics. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16157677 Depletion Von Latent HIV-1 Infektion in Vivo: Ein Proof-of-Concept-Studie Lancet. Aug 13-19, 2005 | Pubmed ID: 16099290 Charakterisierung Von Hortulanus Endogenen Maus-Leukämie-Virus, Ein Endogenes Provirus, Die Eine Infektiöse Maus-Leukämie-Virus Eines Neuen Untergruppe Kodiert Journal of Virology. Jul, 2005 | Pubmed ID: 15956577 Symmetrische Basis Präferenzen Um HIV-1-, Vogel-Sarkomvirus / Leukose-Virus Und Maus-Leukämie-Virus Integrationsstellen Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15802467 Mechanismus Für Die Nukleosid-Analogon-vermittelte Aufhebung Des HIV-1-Replikation: Balance Zwischen RNase H-Aktivität Und Nukleotidexzisionsreparatur Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15684061 Beziehung Zwischen Retrovirale DNA-Integration-Ort-Auswahl Und Wirtszelle Transkription Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15659548 Mehreren Verknüpften Human Immunodeficiency Virus Typ 1 Arzneimittel-Resistenz-Mutationen in Vorbehandelten Patienten Werden Durch Standard-Genotyp-Analyse Verpasst Journal of Clinical Microbiology. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15635002 In-vitro-Charakterisierung Eines Affen-Immunschwächevirus-Human Immunodeficiency Virus (HIV)-Chimäre Exprimieren HIV Typ 1 Reversen Transkriptase, Um Antiviralen Resistenz Im Pigtail Makaken Zu Studieren Journal of Virology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15564466 Evolution Der Retroviren: Fossilien in Unserer DNA Proceedings of the American Philosophical Society. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15551500 Einsträngiges Spezifität Von APOBEC3G Macht Minus-Strang Desaminierung Des HIV-Genoms Nature Structural & Molecular Biology. May, 2004 | Pubmed ID: 15098018 Humanen Endogenen Retrovirus K Solo-LTR Bildung Und Insertions-Polymorphismen: Auswirkungen Auf Die Menschliche Und Viralen Evolution Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14757818 Nichtzufälligen HIV-1 Infektion Und Doppel-Infektion über Direkte Und Zell-vermittelte Signalwege Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14707263 Die Neue Echtzeit-Rückwärts-PCR-Assay Mit Einzelkopie-Empfindlichkeit Für Human Immunodeficiency Virus Typ 1-RNA Im Plasma Transkriptase-eingeleitet Journal of Clinical Microbiology. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14532178 Virologie. Weapons of Mutations Zerstörung Science (New York, N.Y.). Aug, 2003 | Pubmed ID: 12920286 Die Mechanismen Der Aviären Retroviren Wirtsspektrum Erweiterung Journal of Virology. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12767991 Der Einsame Welle Der Asexuellen Evolution Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2003 | Pubmed ID: 12525686 Ein Neuartiges Endogenen Retrovirus-bezogene Element Im Menschlichen Genom Eine DNA-Transposons ähnelt: Beweis Für Eine Evolutionäre Verbindung? Genomics. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12408960 Vorgeschlagene Alternativen Für Die Verwendung Von Anti-HIV-Medikamente: Ist Es Sinnvoll? Drug Resistance Updates : Reviews and Commentaries in Antimicrobial and Anticancer Chemotherapy. Feb, 1999 | Pubmed ID: 11504471 Verstärkung und Quantifizierung von HIV-1 RNA in HIV-infizierten Personen mit Viruslast unter der Nachweisgrenze von Standard Clinical Assays Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 면역학 및 감염병학
Verstärkung und Quantifizierung von HIV-1 RNA in HIV-infizierten Personen mit Viruslast unter der Nachweisgrenze von Standard Clinical Assays Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 면역학 및 감염병학