Summary

Использование Титон системы для изучения молекулярных механизмов регенерации данио рерио

Published: June 25, 2015
doi:

Summary

Here we outline the workflow for using the TetON system to achieve tissue-specific gene expression in the adult regenerating zebrafish tail fin.

Abstract

The zebrafish has become a very important model organism for studying vertebrate development, physiology, disease, and tissue regeneration. A thorough understanding of the molecular and cellular mechanisms involved requires experimental tools that allow for inducible, tissue-specific manipulation of gene expression or signaling pathways. Therefore, we and others have recently adapted the TetON system for use in zebrafish. The TetON system facilitates temporally and spatially-controlled gene expression and we have recently used this tool to probe for tissue-specific functions of Wnt/beta–catenin signaling during zebrafish tail fin regeneration. Here we describe the workflow for using the TetON system to achieve inducible, tissue-specific gene expression in the adult regenerating zebrafish tail fin. This includes the generation of stable transgenic TetActivator and TetResponder lines, transgene induction and techniques for verification of tissue-specific gene expression in the fin regenerate. Thus, this protocol serves as blueprint for setting up a functional TetON system in zebrafish and its subsequent use, in particular for studying fin regeneration.

Introduction

Данио является хорошо создана позвоночных модельный организм для изучения многих аспектов развития, физиологии, болезни, и регенерации. С ростом принятия данио в качестве модели для пост-эмбриональных биологических процессов, экспериментальных инструментов для индуцибельного, тканеспецифической манипуляции экспрессии генов или сигнальных путей становятся все более важными. В частности, исследования в органе и придатков регенерации в взрослых данио пострадали от отсутствия инструментов для вскрытия пространственно-временная требованиям сигнальных путей во время этих регенеративных процессов.

В настоящее время три различные системы были использованы для достижения условное, тканеспецифичную экспрессию генов в регенерации органов взрослых данио: система Cre-LOX, мозаичную экспрессию теплового шока индуцируемых трансгенов использованием транспозонов-опосредованной соматической трансгенеза, и систему TETON 1 -3. Титон относится к варианту тетрациклина-продолжениепроката транскрипции система активации, где выражение активируется в присутствии тетрациклина антибиотик или производным, например доксициклин. Система Cre-LOX, как это до сих пор используется в взрослых рыб, опирается на Тамоксифен контролируемой Cre рекомбиназой (CreERT2), экспрессия которого пространственно ограничено регуляторных элементов ткане-специфических. Cre приводом удаление СТОП кассеты облегчает экспрессию интересующего гена с приводом от промотора, который должен быть активным во всех типах клеток 1. Транспозонов-опосредованной создание мозаично выраженных соматических трансгенов обеспечивает систему для индуцируемой экспрессии трансгена в отдельных клеточных клонов. Введение эмбрионов данио рерио с транспозона, несущего Tol2 представляющий интерес ген под транскрипционным контролем промотора теплового шока приводит к химерных особей, как правило, несущих трансген только в дискретных клеточных клонов в регенерирующей органа 2. В то время как обе системы позволяют условного ткани-SPEэкспрессия генов специфичны, система Cre-LOX не является обратимым, и стратегия с использованием транспозонов основе клонального маркировки страдает от его стохастического характера. Таким образом, мы и другие недавно адаптированы трансгенных систем Титон для использования в данио, которые облегчают времени и пространстве, контролируемая экспрессия генов, что в дополнение перестраиваемой и обратимой 3-5.

Система Титон используется здесь включает в себя трансгенной линии драйвера (TetActivator), в котором доксициклин (DOX) -inducible активатор транскрипции (улучшенный обратный тетрациклина трансактиватор, irtTA, короткие Тета) находится под контролем регуляторных последовательностей генома тканеспецифических. Во-вторых, это требует трансгенной линии ответчика (TetResponder), что таит в себе интерес ген под транскрипционным контролем оператора тетрациклина (TET элемент ответа; TetRE) (1А). Таким образом, использование специфических комбинаций TetActivator и TetResponder линий позволяет условного ткани-SPECIфик манипуляции экспрессии генов.

Мы недавно использовали Титон систему, чтобы зонд для тканеспецифических функций Wnt / бета-катенина сигнализации у взрослых данио регенерации хвостовой плавник 3. В протоколе, изложенной здесь мы описываем рабочий поток для настройки и использования системы Титон у рыбок данио, в частности, для исследований плавника регенерации. Это включает в себя подробные инструкции о том, как генерировать стабильные трансгенных TetActivator и TetResponder линии и протокол для трансгенной индукции у эмбрионов и взрослых данио. Кроме того, мы опишем методы для проверки экспрессии генов тканеспецифической в ​​ребра регенерата, в том числе протокола для подготовки криосрезов взрослых данио плавников. Кроме того, мы обсудим соображения для конструкции TetActivator трансгена, выбор метода трансгенеза и обнаружения экспрессии TetResponder. Следовательно, общая цель этого протокола, чтобы служить в качестве планаДля наладки функциональную систему TETON в данио достичь экспрессии гена условное тканеспецифичную, который может быть применен к любой интересующей ткани.

Мы создали TetActivator вектор, позволяющий для I-SCEI или Tol2-опосредованной поколения устойчивых TetActivator линий с использованием коротких геномных последовательностей, регулирующих (энхансерные фрагменты; Вайдингер лаборатории базы данных плазмиды нет 1247;. 1В). Эта конструкция содержит кассету, состоящую из TetActivator М2 мутантного варианта обратной Tet-репрессора области слита с вирусом простого герпеса VP16 трансактивации домена производная 3F [irtTAM2 (3F)]. Экспрессия TetActivator (Тета) можно легко контролировать, поскольку она является совместной экспрессии с флуорофором AmCyan из той же открытой рамке считывания; p2a пептид опосредует рибосом пропуск, который должен привести к производству Тета и AmCyan как отдельных белков в соотношении 1: 1 отношение 5,6. Конструкция также содержит poylinker 5'-TetActivator кассеты для облегчения введения геномных регуляторных последовательностей, представляющих интерес с использованием обычных методов клонирования.

Кроме того, мы создали конструкцию, состоящую из описанной выше кассеты TetActivator плюс выбор кассеты канамицину (Weidinger лабораторной плазмиды базе данных нет 1180;. Рис 1С), который может быть объединяется в бактериальной искусственной хромосомы (ВАС), содержащего большое области геномной ( Обычно в старт-кодоном гена, экспрессия образец должен быть имитируется трансгена). Обе конструкции доступны из лаборатории Weidinger по запросу.

Protocol

1. Создание трансгенных линий TetActivator рыбы Генерация TetActivator конструкции Клонов регуляторные последовательности процентной верховьях кассеты TetActivator в векторном # 1247 с использованием стандартных методов. Кроме того, использование методов рекомбинации для генерирования BAC, в ?…

Representative Results

Чтобы установить функциональную систему Титон для выражения гена индуцируемой тканеспецифической, трансгенных TetActivator и TetResponder строк, должны быть получены (1А). Это достигается путем microinjecting TetActivator (рис 1B – C) или TetResponder (рис 1E) строит в начале эмбрионо…

Discussion

Взрослый данио обладает удивительной способностью успешно регенерировать много внутренних органов и придатков. Глубокое понимание молекулярных и клеточных механизмов, участвующих требуется тканеспецифичную анализ функций генов и сигнальных путей. К этому, система Титон обеспечива…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Авторы благодарят Криста Гаазе, Дорис Вебер и Брижит Korte для оказания технической помощи. Работа в лаборатории Weidinger поддерживается грантами Немецкого исследовательского WE 4223 / 3-1, мы 4223 / 4-1 и Немецким обществом по Kardiologie через Oskar-Lapp-стипендию и Клаус-Георг-унд-Sigrid- Hengstberger-Forschungsstipendium.

Materials

Breeding boxes Aqua Schwarz AquaBox 1
Compound fluorescent microscope e.g. Leica, Zeiss varies with the manufacturer to image fluorescent tissue sections
Confocal microscope e.g. Leica, Zeiss varies with the manufacturer to image fluorescent tissue sections
Cryostat e.g. Leica, Thermo-Scientific varies with the manufacturer for cryosectioning
4’, 6- diamidino-2-phenylinodole (Dapi) Sigma-Aldrich D9542 use 1/5000 in PBS
for visualization of nuclei
Doxycycline Sigma-Aldrich D9891 prepare stocks in 50% EtOH at 50 mg/ml (97 mM)
for TetResponder induction
E3 embryo medium  5 mM NaCl, 0.17 mM KCl, 0.33 mM CaCl2· 2 H2O, 0.33 mM MgSO4·7 H2O, 0.2 ‰ (w/v) methylene blue, pH 6.5
for embryo/larvae husbandry
Paraformaldehyde (PFA) Sigma-Aldrich P6148 4 % (w/v) paraformaldehyde in PBS, pH 7.5
for fixation
1x Phosphat-buffer saline (PBS) 1.7 mM KH2PO4, 5.2 mM Na2HPO4, 150 mM NaCl, pH 7.5
1x Phosphat-buffer saline + Tween 20 (PBT) 1x PBS with 0.1 % Tween 20
Superfrost Ultra Plus adhesion microscope slides Thermo Scientific  1014356190 for collection of tissue sections
Stereo fluorescent microscope e.g. Leica, Zeiss varies with the manufacturer for fluorescence-based genotyping
Thermocycler e.g. Biorad, Applied Biosystems varies with the manufacturer for PCR-based genotyping
Tissue freezing medium (TFM) Triangel Biomedical Sciences TFM-C for embedding of tissue samples
Tricaine (L-Ethyl-m-amino-benzoate-methane sulfonate/MS-222) Sigma-Aldrich E10521 for anesthesia
use at 1 mg/ml in E3 embryo medium

References

  1. Fang, Y., et al. Translational profiling of cardiomyocytes identifies an early Jak1/Stat3 injury response required for zebrafish heart regeneration. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (33), 13416-13421 (2013).
  2. Tryon, R. C., Johnson, S. L. Clonal analysis of kit ligand a functional expression reveals lineage-specific competence to promote melanocyte rescue in the mutant regenerating caudal fin. PloS one. 9 (7), e102317 (2014).
  3. Wehner, D., et al. Wnt/beta-catenin signaling defines organizing centers that orchestrate growth and differentiation of the regenerating zebrafish caudal fin. Cell Rep. 6 (3), 467-481 (2014).
  4. Huang, C. J., et al. Conditional expression of a myocardium-specific transgene in zebrafish transgenic lines. Dev Dyn. 233 (4), 1294-1303 (2005).
  5. Knopf, F., et al. Dually inducible TetON systems for tissue-specific conditional gene expression in zebrafish. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (46), 19933-19938 (2010).
  6. Provost, E., Rhee, J., Leach, S. D. Viral 2A peptides allow expression of multiple proteins from a single ORF in transgenic zebrafish embryos. Genesis. 45 (10), 625-629 (2007).
  7. Suster, M. L., Abe, G., Schouw, A., Kawakami, K. Transposon-mediated BAC transgenesis in zebrafish. Nat Protoc. 6 (12), 1998-2021 (2011).
  8. Bussmann, J., Schulte-Merker, S. Rapid BAC selection for tol2-mediated transgenesis in zebrafish. Development. 138 (19), 4327-4332 (2011).
  9. Yuan, S., Sun, Z. Microinjection of mRNA and morpholino antisense oligonucleotides in zebrafish embryos. J Vis Exp. (27), (2009).
  10. Kim, J. H., et al. High cleavage efficiency of a 2A peptide derived from porcine teschovirus-1 in human cell lines, zebrafish and mice. PloS one. 6 (4), e18556 (2011).
  11. Matthews, M., Varga, Z. M. Anesthesia and euthanasia in zebrafish. ILAR journal / National Research Council, Institute of Laboratory Animal Resources. 53 (2), 192-204 (2012).
  12. Hyde, D. R., Godwin, A. R., Thummel, R. In vivo electroporation of morpholinos into the regenerating adult zebrafish tail fin. J Vis Exp. (61), (2012).
  13. Meeker, N. D., Hutchinson, S. A., Ho, L., Trede, N. S. Method for isolation of PCR-ready genomic DNA from zebrafish tissues. Biotechniques. 43 (5), 610 (2007).
  14. Thermes, V., et al. I-SceI meganuclease mediates highly efficient transgenesis in fish. Mech Dev. 118 (1-2), 91-98 (2002).
  15. Suster, M. L., Kikuta, H., Urasaki, A., Asakawa, K., Kawakami, K. Transgenesis in zebrafish with the tol2 transposon system. Methods Mol Biol. , 56141-56163 (2009).
  16. Grabher, C., Wittbrodt, J. Meganuclease and transposon mediated transgenesis in medaka. Genome Biol. 8, (2007).

Play Video

Cite This Article
Wehner, D., Jahn, C., Weidinger, G. Use of the TetON System to Study Molecular Mechanisms of Zebrafish Regeneration. J. Vis. Exp. (100), e52756, doi:10.3791/52756 (2015).

View Video