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ロングレンジDNAの相互作用を識別するための関連する染色体のトラップ

JoVE 신문
생물학

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JoVE 신문 생물학

Associated Chromosome Trap for Identifying Long-range DNA Interactions

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ロングレンジDNAの相互作用を識別するための関連する染色体のトラップ

DOI:

•

14:49 min

•

April 23, 2011

•

Jianqun Ling, Andrew R. Hoffman

¹Medical Service, VA Palo Alto Health Care System ,Stanford University School of Medicine

Chapters

00:05Title
01:30Formaldehyde Fixation of Long-Range Chromatin Interactions and Nuclei Isolation
03:36Digestion, Ligation and Purification of Interaction DNA Segments
06:10Digestion with Msp I and Ligation with Oligonucleotide Linkers
07:50PCR Amplification and Sequence Analysis
11:06Act Assay Representative Results
14:23Conclusion

Summary

자동 번역

関連する染色体のトラップ（ACT）アッセイは、長距離DNA相互作用を同定するための新たな方法です。長い範囲のDNAの相互作用の特徴付けは、私たちは両方の通常の生理機能と疾患状態における遺伝子発現への核アーキテクチャの関係を判別することができます。

Tags

Associated Chromosome Trap Long-range DNA Interactions Chromatin Structure Chromosome Territories Gene Expression Transcriptional Factories Co-localization ACT Assay Chromosome Conformation Capture Technique Transcriptional Regulation Nuclear Architecture Gene Expression In Disease States

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