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Esgotamento de RNA ribossômico para metagenomico Gut Mosquito RNA-seq
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

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Chapters

  • 00:02Title
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

자동 번역

A ribosomal RNA protocolo de depleção (rRNA) foi desenvolvido para enriquecer o RNA mensageiro (mRNA) de RNA-seq do intestino metatranscriptome mosquito. Sondas de amostras específicas rRNA, que foram usados ​​para remover rRNA via subtração, foram criados a partir do mosquito e seus micróbios intestinais. Desempenho do protocolo pode resultar na remoção de aproximadamente 90-99% do rRNA.

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