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Flusso di lavoro per High-contenuti, Quantificazione singola cella di fluorescenti Marcatori da Universal Microscopio dati, supportati da Open Source Software
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
Workflow for High-content, Individual Cell Quantification of Fluorescent Markers from Universal Microscope Data, Supported by Open Source Software
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Flusso di lavoro per High-contenuti, Quantificazione singola cella di fluorescenti Marcatori da Universal Microscopio dati, supportati da Open Source Software

DOI:
10.3791/51882-v

•

09:57 min

•

December 16, 2014

•

,
1Cancer Biology,UCL Cancer Institute

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:17Reverse Transfection siRNA Screening
  • 03:20Imaging and Image Segmentation
  • 05:21Data Extraction
  • 07:39Results: Representative Raw Individual Cell Data Processing
  • 09:27Conclusion

Summary

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Presentato è un flusso di lavoro flessibile, l'informatica che consente l'analisi di immagini basata multiplex di cellule fluorescente. Il flusso di lavoro quantifica marcatori nucleari e citoplasmatici e calcola marcatore traslocazione tra questi compartimenti. Le procedure sono previste per la perturbazione di cellule utilizzando siRNA e metodologia affidabile per il rilevamento marcatore mediante immunofluorescenza indiretta in formati da 96 pozzetti.

Tags

Keywords: Cell QuantificationFluorescent MarkersHigh-content MicroscopySingle-cell AnalysisCell HeterogeneityCell ProfilerOpen-source SoftwareSubcellular SegmentationSiRNA ScreenG1 Checkpoint RegulatorsCell PerturbationFluorescence-based Cellular Markers

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