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L'utilisation d'un PCR-capillaire fluorescent Gel Electrophoresis Technique pour Génotype CRISPR / cas9 médiation Knockout Mutants dans un format à haut débit

JoVE 신문
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JoVE 신문 유전학

Using a Fluorescent PCR-capillary Gel Electrophoresis Technique to Genotype CRISPR/Cas9-mediated Knockout Mutants in a High-throughput Format

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L'utilisation d'un PCR-capillaire fluorescent Gel Electrophoresis Technique pour Génotype CRISPR / cas9 médiation Knockout Mutants dans un format à haut débit

DOI:

10.3791/55586-v

•

08:25 min

•

April 08, 2017

•

Muhammad Khairul Ramlee, Jing Wang, Alice M. S. Cheung, Shang Li

¹Cancer & Stem Cell Biology Programme,Duke-NUS Medical School

Chapters

00:05Title
00:55Sample Preparation and Amplification of CRISPER/Cas9 Regions with Fluorescent PCR
04:32Capillary Gel Electrophoresis and Electropherogram Analysis
06:25Results: Genotyping HEPG2 Targeted with CRISPER/Cas9 Construct Against NAP1L1
07:27Conclusion

Summary

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La technique de génotypage décrit ici, qui couple de réaction en chaîne par polymérase fluorescente (PCR) à une électrophorèse sur gel capillaire, permet de génotypage à haut débit des clones knock-out à médiation par nuclease. Il évite les limitations rencontrées par d'autres techniques de génotypage et est plus rentable que les méthodes de séquençage.

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Perturbations de circulation miARN dans le syndrome du côlon irritable détectée en utilisant un multiplexée à haut débit Gene Expression Plate-forme

À haut débit robotisé Isolation assistée sensible à la température létale Mutants en<em> Chlamydomonas reinhardtii</em

Génération indépendante et dépendante de la sélection de CRISPR / Cas9-Meded Knockouts dans les cellules de mammifères

Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

G2-seq : Une haut débit basée sur le séquençage Technique d’identification tard reproduisant des régions du génome

CRISPR/Cas9-médiation ciblée Integration In Vivo en utilisant une stratégie de base rejoindre fin médiée par homologie

Un protocole pour la Production de vecteurs LENTIVIRAUX intégrase déficient pour CRISPR/Cas9-mediated Gene Knockout dans les cellules en Division

Identification de haut débit synergique des associations de médicaments par la méthode² de chevauchement

Un rapide et Facile de Pipeline pour générer des Mutants de Point génomique dans c. elegans en utilisant CRISPR/Cas9 ribonucléoprotéines

High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

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High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

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