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斑马鱼 RNASeq-based 基因表达数据的样品制备与分析
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Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
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Click here for the English version.
斑马鱼 RNASeq-based 基因表达数据的样品制备与分析
DOI:
10.3791/56187-v
•
11:42 min
•
October 27, 2017
•
Timothy L. Hostelley*
1
,
Jessica E. Nesmith*
1
,
Norann A. Zaghloul
1
Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine
,
University of Maryland School of Medicine
Chapters
00:05
Title
01:04
Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
02:22
Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
04:55
Sorting Differentially Expressed Genes
07:00
Determine Enriched Pathways
07:57
Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
09:12
Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
10:47
Conclusion
Summary
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该协议提出了一种从斑马鱼胚胎, 幼虫, 或排序细胞的整体转录分析的方法。我们包括 RNA 的分离, RNASeq 数据的通路分析, 和 qRT pcr 验证基因表达的变化。
Tags
RNASeq
Gene Expression
Zebrafish
Embryo
Larva
Transcriptome
Sample Preparation
RNA Extraction
RNA Sequencing
발생학
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