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펩타이드 농축 및 질량 분광법에 의한 단백질 유비퀴틴화 부위 검출
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Detection of Protein Ubiquitination Sites by Peptide Enrichment and Mass Spectrometry
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펩타이드 농축 및 질량 분광법에 의한 단백질 유비퀴틴화 부위 검출

DOI:
10.3791/59079-v

•

11:54 min

•

March 23, 2020

•

, ,
1Proteomics Center,Erasmus University Medical Center

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:16Sample Preparation
  • 03:36Offline Peptide Fractionation
  • 06:16Nanoflow LC-MS/MS
  • 07:51Data Analysis
  • 09:00Results: Detection of diGly Peptides Using Nanoflow LC-MS/MS
  • 10:51Conclusion

Summary

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우리는 복잡한 생물학적 샘플에서 유비퀴틴화 된 단백질에서 유래 한 diGly 펩티드의 정제, 검출 및 식별방법을 제시합니다. 제시된 방법은 유비퀴티노메 분석의 깊이 수준에 대하여 공표된 방법을 재현가능하고 견고하며 능가합니다.

Tags

Protein UbiquitinationDiGly PeptidesMass SpectrometrySILACProtein EnrichmentLys-CTrypsin DigestionTFA Precipitation

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