This content is Free Access.
Chapters
- 00:04Title
- 01:10Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
- 02:02Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
- 02:47Work with Previous Experiments
- 03:22Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
- 04:07Clustering Samples Using Protein Data
- 04:49Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
- 05:32Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
- 06:51Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
- 08:28Conclusion
IDBac является открытым исходным кодом масс-спектрометрии основе биоинформатики трубопровода, который объединяет данные из нетронутых белков и специализированных метаболитов спектра, собранные на клеточном материале Царапины из бактериальных колоний. Трубопровод позволяет исследователям быстро организовать сотни до тысячи бактериальных колоний в таксономические группы, и далее дифференцировать их на основе специализированного производства метаболита.
