This content is Free Access.
Chapters
- 00:04Title
- 01:10Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
- 02:02Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
- 02:47Work with Previous Experiments
- 03:22Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
- 04:07Clustering Samples Using Protein Data
- 04:49Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
- 05:32Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
- 06:51Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
- 08:28Conclusion
IDBac är en öppen källkod masspektrometri-baserad bioinformatik pipeline som integrerar data från både intakt protein och specialiserade metabolitspektra, som samlats in på cell material skrapats från bakteriella kolonier. Pipelinen gör det möjligt för forskare att snabbt organisera hundratals till tusentals bakteriella kolonier till förmodade taxonomiska grupper, och ytterligare differentiera dem baserat på specialiserad metabolit produktion.
