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합성 치명적인 상호 작용을 대상으로 하는 약물 조합을 식별 하기 위해 데이터 통합 워크플로우

JoVE 신문
암 연구학

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JoVE 신문 암 연구학

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions

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합성 치명적인 상호 작용을 대상으로 하는 약물 조합을 식별 하기 위해 데이터 통합 워크플로우

DOI:

10.3791/60328-v

•

07:40 min

•

May 27, 2021

•

Maximilian Marhold, Andreas Heinzel, Almas Merchant, Paul Perco, Michael Krainer

¹Department of Internal Medicine I – Division of Oncology, Comprehensive Cancer Center,Medical University of Vienna, ²Department of Nephrology,Medical University of Vienna, ³Department of Internal Medicine IV,Medical University Innsbruck

Chapters

00:04Introduction
01:03Retrieving Synthetic Lethal Gene Pairs
01:48Translating Synthetic Lethal Gene Pairs to Human Orthologs
03:20Mapping Synthetic Lethal Interaction Partners to Drugs
04:28Establish the Set of Currently Tested Drug Combinations in Clinical Trials
04:45Testing Proposed Drug Combinations In Vitro
05:28Results: Proposed Novel Drug Combinations for Ovarian and Breast Cancer
06:37Conclusion

Summary

자동 번역

모형 유기체에 있는 큰 유전 스크린은 부정적인 유전 상호 작용의 확인으로 이끌어 냈습니다. 여기에서는 모델 유기체의 유전 화면에서 데이터를 사용하여 암에 있는 합성 치명적인 상호 작용을 표적으로 하는 약물 조합을 설명하는 데이터 통합 워크플로우를 설명합니다.

Tags

Keywords: Data Integration Drug Combinations Synthetic Lethality BioGRID Negative Genetic Interactions Model Organism Ensembl BioMart Orthologous Genes Data Retrieval Cancer BRCA PARP Inhibitors

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