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크로마틴 구성의 전산 분석을 사용하여 알츠하이머 병 변이체를 대상 유전자에 매핑

JoVE 신문
유전학

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JoVE 신문 유전학

Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

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크로마틴 구성의 전산 분석을 사용하여 알츠하이머 병 변이체를 대상 유전자에 매핑

DOI:

10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

Nana Matoba², Ivana Y. Quiroga, Douglas H. Phanstiel*^3,4, Hyejung Won*^1,2

¹Department of Genetics,University of North Carolina, ²Neuroscience Center,University of North Carolina, ³Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, ⁴Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Chapters

00:05Title
01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
01:53Developmental Expression Trajectories
02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
03:52Conclusion

Summary

자동 번역

우리는 3차원 염색질 상호 작용을 사용하여 게놈 전체 협회 연구 (GWAS)에 의해 확인된 비 코딩 이체의 기능적인 연루를 확인하기 위하여 프로토콜을 제시합니다.

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Keywords: Alzheimer’s Disease GWAS Chromatin Configuration Computational Analysis Target Genes SNPs Hi-C Gene Expression Cell-type Expression Gene Annotation Enrichment

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