Journal
/
유전학
/
Kortlægning af Alzheimers sygdom varianter til deres Målgener ved hjælp af beregningsmæssige analyse af kromatin konfiguration
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Kortlægning af Alzheimers sygdom varianter til deres Målgener ved hjælp af beregningsmæssige analyse af kromatin konfiguration

DOI:
10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

, , ,
1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Vi præsenterer en protokol til at identificere funktionelle konsekvenser af ikke-kodning varianter identificeret ved genomdækkende Association undersøgelser (GWAS) ved hjælp af tredimensionelle kromatin interaktioner.

Tags

Keywords: Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/60428?article_type=v

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen
check_url/kr/60428?article_type=v

Sekventiel Salt ekstraktioner til analyse af Bulk kromatin bindende egenskaber af kromatin ændre komplekser
check_url/kr/60428?article_type=v

Analyse af c-KIT ligand-promotoren ved anvendelse af chromatinimmunpræcipitation
check_url/kr/60428?article_type=v

Retroviral Scanning: Kortlægning af MLV Integration Sites til at definere Cell-specifikke Regulatory Regions
check_url/kr/60428?article_type=v

Kortlægning Genome-wide tilgængelige kromatin i primære humane T lymfocytter af ATAC-Seq
check_url/kr/60428?article_type=v

Immunfarvning for DNA ændringer: beregningsmæssige analyse af Konfokal billeder
check_url/kr/60428?article_type=v

Ved hjælp af Sniper-Cas9 til at minimere Off target effekter af CRISPR-Cas9 uden tab af målaktiviteten Via styret Evolution
check_url/kr/60428?article_type=v

En in vitro-protokol til evaluering af MicroRNA-niveauer, funktioner og tilknyttede Målgener i tumor celler
check_url/kr/60428?article_type=v

In vivo funktionel undersøgelse af sygdoms associerede sjældne humane varianter ved hjælp af Drosophila
check_url/kr/60428?article_type=v

Identifikation af cirkulære RNAs ved hjælp af RNA-sekvensering

Read Article