Journal
/
Immunology and Infection
/
Visualisering och kvantifiering av högdimensionella Cytometridata med hjälp av Cytofast och uppströms klustring metoder FlowSOM och Cytosplore
JoVE Journal
Immunology and Infection
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunology and Infection
Visualization and Quantification of High-Dimensional Cytometry Data using Cytofast and the Upstream Clustering Methods FlowSOM and Cytosplore
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Visualisering och kvantifiering av högdimensionella Cytometridata med hjälp av Cytofast och uppströms klustring metoder FlowSOM och Cytosplore

DOI:
10.3791/60525-v

•

06:01 min

•

December 12, 2019

•

, , ,
1Department of Immunohematology and Blood Transfusion,Leiden University Medical Center, 2Department of Parasitology,Leiden University Medical Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:49Creating Clusters
  • 03:30Post-processing Clustering Analysis
  • 04:18Results: Cytofast Analysis
  • 05:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Cytofast är ett visualiseringsverktyg som används för att analysera utdata från klustring. Cytofast kan användas för att jämföra två kluster metoder: Flowsom och cytosplore. Cytofast kan snabbt generera en kvantitativ och kvalitativ översikt av massan flödescytometrianalys data och belysa de viktigaste skillnaderna mellan olika klusteralgoritmer.

Tags

Cytometry DataCytofastFlowSOMCytosploreHigh-dimensional DataVisualizationQuantificationCell SubsetsImmunological PatternsClinical TreatmentExperimental GroupsClusteringFCS FilesHSNETSNEMetadataFlowSet

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/60525?article_type=v

Användning av Image Cytometry för kvantifiering av patogena svampar i föreningen med värdceller
check_url/60525?article_type=v

ScanLag: hög kapacitet Kvantifiering av Colony Tillväxt och Lag Tid
check_url/60525?article_type=v

Bedöma Retinal mikrogliaceller fagocytos<em> In Vivo</em> Med hjälp av en flödescytometri-baserad analys
check_url/60525?article_type=v

Kvalitativ och kvantitativ analys av immun synapsen i det mänskliga systemet använder Imaging flödescytometri
check_url/60525?article_type=v

Isolering, karakterisering och rening av makrofager från vävnader som påverkas av fetma-relaterade Inflammation
check_url/60525?article_type=v

ExCYT: Ett grafiskt användargränssnitt för att effektivisera analys av högdimensionella flödescytometri Data
check_url/60525?article_type=v

Multicolor flöde flödescytometri-baserade kvantifiering av mitokondrier och lysosomer i T-celler
check_url/60525?article_type=v

Visualisering, kvantifiering och kartläggning av immuncellpopulationer i tumörmikromiljön
check_url/60525?article_type=v

Visualisering av bakteriell resistens med fluorescerande antibiotikasonder
check_url/60525?article_type=v

Visualisering av SARS-CoV-2 med immun RNA-fluorescens i Situ hybridisering

Read Article