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Visualização e quantificação de dados de citometria de alta dimensão usando Cytofast e os métodos de agrupamento upstream FlowSOM e Cytosplore
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JoVE Journal Immunology and Infection
Visualization and Quantification of High-Dimensional Cytometry Data using Cytofast and the Upstream Clustering Methods FlowSOM and Cytosplore

Visualização e quantificação de dados de citometria de alta dimensão usando Cytofast e os métodos de agrupamento upstream FlowSOM e Cytosplore

DOI:
10.3791/60525-v

•

06:01 min

•

December 12, 2019

•

, , ,
1Department of Immunohematology and Blood Transfusion,Leiden University Medical Center, 2Department of Parasitology,Leiden University Medical Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:49Creating Clusters
  • 03:30Post-processing Clustering Analysis
  • 04:18Results: Cytofast Analysis
  • 05:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Cytofast é uma ferramenta de visualização usada para analisar a saída do agrupamento. Cytofast pode ser usado para comparar dois métodos de agrupamento: FlowSOM e Cytosplore. Cytofast pode rapidamente gerar uma visão quantitativa e qualitativa dos dados de citometria de massa e destacar as principais diferenças entre diferentes algoritmos de agrupamento.

Tags

Keywords: Cytometry DataCytofastFlowSOMCytosploreHigh-dimensional DataVisualizationQuantificationCell SubsetsImmunological PatternsClinical TreatmentExperimental GroupsClusteringFCS FilesHSNETSNEMetadataFlowSet

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