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Combinación de dispositivos fluidos con microscopía y citometría de flujo para estudiar el transporte microbiano en medios porosos a través de escalas espaciales
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JoVE 신문 환경과학
Combining Fluidic Devices with Microscopy and Flow Cytometry to Study Microbial Transport in Porous Media Across Spatial Scales
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Combinación de dispositivos fluidos con microscopía y citometría de flujo para estudiar el transporte microbiano en medios porosos a través de escalas espaciales

DOI:
10.3791/60701-v

•

12:32 min

•

November 25, 2020

•

, , ,
1Stream Biofilm and Ecosystem Research Laboratory,École Polytechnique Fédérale de Lausanne, 2Institute of Earth Sciences,University of Lausanne, CH-1015

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:57Preparation of A Microfluidic Device in Polydimethylsiloxane (PDMS)
  • 03:27Preparation of a Fluidic Device in Poly(methyl methacrylate)(PMMA)
  • 04:09Analyze Bacterial Transport using PDMS Microfluidic Devices
  • 05:10Basic Image Processing
  • 06:59Analyze Bacterial Transport at the Pore Scale
  • 08:08Study Bacterial Filtration by Means of Deposition Profiles
  • 08:51Analyze Bacterial Transport using PMMA Fluidic Devices
  • 10:33Results: Motile and Nonmotile GFP-tagged P. putida KT2440
  • 11:48Conclusion

Summary

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Las curvas innovadoras (BTC) son herramientas eficientes para estudiar el transporte de bacterias en medios porosos. Aquí introducimos herramientas basadas en dispositivos fluidos en combinación con microscopía y conteo citométrico de flujo para obtener BTC.

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Keywords: Microfluidic DevicesMicroscopyFlow CytometryBacterial TransportPorous MediaSpatial ScalesBioremediationContaminationDisease SpreadMathematical ModelsSingle CellPopulationMicrobial CommunityPDMSSU-8 PhotolithographyPorous GeometryFluidic DevicesAutomated DispenserLaboratory-scale Column StudiesField Surveys

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