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유전학
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使用染色质免疫沉淀和高通量测序(ChIP-seq)发现
沙门氏菌
生物膜中的CsgD监管目标
JoVE 신문
유전학
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JoVE 신문
유전학
Discovering CsgD Regulatory Targets in
Salmonella
Biofilm Using Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-seq)
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使用染色质免疫沉淀和高通量测序(ChIP-seq)发现
沙门氏菌
生物膜中的CsgD监管目标
DOI:
10.3791/60736-v
•
13:48 min
•
January 18, 2020
•
Melissa B. Palmer
2
,
Yejun Wang
,
Aaron P. White
2
1
Vaccine and Infectious Disease Organization-International Vaccine Centre
,
2
Department of Biochemistry, Microbiology and Immunology
,
University of Saskatchewan
,
3
Department of Cell Biology and Genetics
,
Shenzhen University Health Science Center
Chapters
00:00
Title
02:01
Protocol
12:04
Results
12:41
Conclusion
Summary
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染色质免疫沉淀与下一代测序(ChIP-seq)相结合,是一种用于建立转录因子与其控制的基因组序列之间的相互作用的方法。该协议概述了使用细菌生物膜执行ChIP-seq的技术,以
沙门氏菌肠
杆菌菌膜为例。
Tags
ChIP-seq
Chromatin Immunoprecipitation
Transcription Factors
DNA-binding Proteins
Salmonella
Biofilms
CsgD
Gene Regulation
Bacterial Gene Expression
High-throughput Sequencing
Regulatory Targets
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