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通过微生物组数据中的线性判别分析效应大小(LEfSe)辅助选择生物标志物
JoVE 신문
유전학
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JoVE 신문 유전학
Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data
DOI:

04:57 min

May 16, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:39Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) Native Analysis
  • 01:49LEfSe Online Analysis (Galaxy)
  • 03:05Results: Representative Microbiome LEfSe Characterization
  • 04:21Conclusion

Summary

자동 번역

LEfSe(LDA效应大小)是一种用于高维生物标志物挖掘的工具,用于识别基因组特征(例如基因,途径和分类法),这些特征显着表征微生物组数据中的两个或多个组。

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