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Estudos de associação multi-omics em larga escala (Mo-GWAS): Diretrizes para preparação e normalização de amostras
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Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

Estudos de associação multi-omics em larga escala (Mo-GWAS): Diretrizes para preparação e normalização de amostras

DOI:
10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

, ,
1Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, 2Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:48Preparation of Biological Plant Material
  • 01:57Sample Extraction
  • 03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
  • 05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
  • 06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
  • 07:45Conclusion

Summary

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Neste protocolo, apresentamos um fluxo de trabalho otimizado, que combina uma preparação eficiente e rápida de amostras de muitas amostras. Além disso, fornecemos um guia passo-a-passo para reduzir as variações analíticas para avaliação de alto rendimento de estudos metabólicos de GWAS.

Tags

Multi-omicsGenome-wide Association StudiesMo-GWASSample PreparationNormalizationTechnical VariationBiological VarianceMetabolitesAnalytical PlatformGenotypic InformationPhenotypic InformationNatural PopulationFlash FreezingExtractionCentrifugationSolvent EvaporationGCMSUHPLC-MS

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