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Journal
/
생물학
/
Single-Nucleus RNA 시퀀싱을 위한 성인 마우스 신장에서 핵 분리
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문
생물학
Nuclei Isolation from Adult Mouse Kidney for Single-Nucleus RNA-Sequencing
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Single-Nucleus RNA 시퀀싱을 위한 성인 마우스 신장에서 핵 분리
DOI:
10.3791/62901-v
•
06:00 min
•
September 20, 2021
•
Janna Leiz*
1,2
,
Christian Hinze*
1,2
,
Anastasiya Boltengagen
,
Caroline Braeuning
,
Christine Kocks
,
Nikolaus Rajewsky
,
Kai M. Schmidt-Ott
2
1
Department of Nephrology and Medical Intensive Care Medicine
,
Charité – Universitätsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universität Berlin and Humboldt-Universität zu Berlin
,
2
Molecular and Translational Kidney Research
,
Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association (MDC)
,
3
Berlin Institute of Medical Systems Biology (BIMSB), Systems Biology of Gene Regulatory Elements
,
Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association (MDC)
,
4
Berlin Institute of Medical Systems Biology (BIMSB)
,
Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association (MDC)
Chapters
00:04
Introduction
00:41
Tissue Preparation
01:41
Tissue Homogenization and Cell Lysis
03:11
Nuclei Purification
04:40
Results: Single‐Nucleus RNA‐Sequencing Using Nuclei Isolated from Adult Mouse Kidney
05:30
Conclusion
Summary
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여기에서 우리는 수질 신장 세포 유형의 표현을 개선하고 효소 조직 해리로 인한 유전자 발현 아티팩트를 방지하는 냉동 마우스 신장에서 고품질 핵을 분리하는 프로토콜을 제시합니다.
Tags
Nuclei Isolation
Single-nucleus RNA-sequencing
Cortex
Medulla
RNA Stabilization
Nuclei Lysis Buffer
Cell Lysis
Cell Straining
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