يوفر التوصيف الطيفي الكتلي للببتيدات العصبية معلومات التسلسل والقياس الكمي والتوطين. سير العمل المحسن هذا ليس مفيدا فقط لدراسات الببتيد neuropeptide ، ولكن أيضا الببتيدات الداخلية الأخرى. تصف البروتوكولات المقدمة هنا إعداد العينات ، والحصول على MS ، وتحليل MS ، وتوليد قاعدة بيانات من neuropeptides باستخدام LC-ESI-MS ، MALDI-MS اكتشاف ، وتصوير MALDI-MS.