Journal
/
생물학
/
I Silico Identifiering och karakterisering av circRNA under värd-patogeninteraktioner
JoVE 신문
생물학
Author Produced
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생물학
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

I Silico Identifiering och karakterisering av circRNA under värd-patogeninteraktioner

DOI:
10.3791/64565-v

•

10:27 min

•

October 21, 2022

•

, , ,
1Institute of Biological Sciences, Faculty of Science,Universiti Malaya, 2Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR),Universiti Malaya

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Protokollet som lämnas in här förklarar den kompletta in silico-pipeline som behövs för att förutsäga och funktionellt karakterisera circRNA från RNA-sekvenseringstranskriptomdata som studerar värd-patogeninteraktioner.

Tags

Keywords: CircRNAHost-pathogen InteractionsIn Silico IdentificationCharacterizationBioinformaticsRNA-seq AnalysisDifferential Expression AnalysisCiriquantPrepDE.pyCiri DE ReplicateLinuxProgrammingProtocolWorkflow

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/64565?article_type=v

Identifiering och karakterisering av protein glykosylering med särskilda endo-och exoglycosidases
check_url/kr/64565?article_type=v

Snabb genetisk analys av Epithelial-mesenkymala Signaling Under Hair Regeneration
check_url/kr/64565?article_type=v

Live avbildning av Apoptotic Cell Utförsäljning under<em> Drosophila</em> Embryogenesis
check_url/kr/64565?article_type=v

Den MultiBac Protein Complex Production Platform vid EMBL
check_url/kr/64565?article_type=v

Pyrosequencing för Mikrobiell identifiering och karakterisering
check_url/kr/64565?article_type=v

Protein visdom: En Workbench för<em> I silico</em><em> De novo</em> Design av biomolekyler
check_url/kr/64565?article_type=v

Snabb Identifiering av kemiska genetiska interaktioner i<em> Saccharomyces cerevisiae</em
check_url/kr/64565?article_type=v

Kromatin Immunoprecipitation analys för identifiering av Arabidopsis Protein-DNA-interaktioner<em> In Vivo</em
check_url/kr/64565?article_type=v

Anläggningen arrangören analys: Identifiering och karakterisering av roten knöl specifika promotorn i gemensamma bönan
check_url/kr/64565?article_type=v

Identifiering av nya regulatorer av växttranspiration genom storskalig termisk avbildningsscreening i Helianthus Annuus

Read Article