Journal
/
Biology
/
Forstå virkningen av tempererte bakteriofager på deres lysogener gjennom transkriptomikk
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Understanding the Impact of Temperate Bacteriophages on Their Lysogens Through Transcriptomics

Forstå virkningen av tempererte bakteriofager på deres lysogener gjennom transkriptomikk

DOI:
10.3791/64945-v

•

09:23 min

•

January 05, 2024

•

, , , , , ,
1Department of Clinical Infection, Microbiology and Immunology, Institute of Infection, Veterinary and Ecological Sciences (IVES),University of Liverpool, 2School of Science, Engineering, and Environment,University of Salford

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:20Temporal Direct Enumeration of Spontaneous Induction
  • 02:56Preparation of Un‐Induced and Induced Lysogen Cultures for RNA Extraction
  • 05:00Standard Curve and Quantitative‐PCR
  • 06:42Results: Understanding the Impact of Prophages on Their Hosts Using PFU and RT‐qPCR
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokollen gjør det mulig å avsløre virkningen av profager på vertene. Bakteriekulturer synkroniseres ved hjelp av forhold som best støtter den lysogene tilstanden, og begrenser spontan induksjon. RT-qPCR skiller utvetydig profagbegrensede gener og de som ikke er koblet fra fagkontroll fra de som uttrykkes under den lytiske replikasjonssyklusen.

Tags

Temperate BacteriophagesProphagesTranscriptomic ApproachBacterial HostsLysogenLytic CycleGene ExpressionBacterial PathogensTherapeutic TargetsRNA IntegrityIndicator HostLysogensInfective Phage ParticlesRifampicin ResistantTop Agar Layer

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/64945?article_type=v

Understanding Cerebellar Pattern Formation
check_url/64945?article_type=v

Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
check_url/64945?article_type=v

Intraperitoneal Injection into Adult Zebrafish
check_url/64945?article_type=v

Analyzing the Function of Small GTPases by Microinjection of Plasmids into Polarized Epithelial Cells
check_url/64945?article_type=v

Formuleringer for frysetørking av bakterier og deres innflytelse på Cell Survival
check_url/64945?article_type=v

En standardisert metode for analyse av Liver Sinus endotelceller og deres Fenestrations ved scanning elektronmikroskopi
check_url/64945?article_type=v

SA-β-Galaktosidase-basert screening analysen for identifisering av Senotherapeutic narkotika
check_url/64945?article_type=v

Slippverktøy Barcoding-baserte enkelt celle Transcriptomics av voksen pattedyr vev
check_url/64945?article_type=v

En Adipocyte-cellekulturmodell for å studere virkningen av protein- og mikro-RNA-modulering på adipocyttfunksjon
check_url/64945?article_type=v

Single Myofiber Culture Assay for vurdering av voksen muskel stamcelle funksjonalitet Ex Vivo

Read Article