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トランスクリプトミクスによる温帯バクテリオファージの溶解原体への影響の理解
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Understanding the Impact of Temperate Bacteriophages on Their Lysogens Through Transcriptomics
DOI:

09:23 min

January 05, 2024

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:20Temporal Direct Enumeration of Spontaneous Induction
  • 02:56Preparation of Un‐Induced and Induced Lysogen Cultures for RNA Extraction
  • 05:00Standard Curve and Quantitative‐PCR
  • 06:42Results: Understanding the Impact of Prophages on Their Hosts Using PFU and RT‐qPCR
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

このプロトコルにより、宿主に対するプロファージの影響を明らかにすることができます。細菌培養は、溶解原性状態を最もよくサポートする条件を使用して同期され、自発的な誘導が制限されます。RT-qPCRは、増殖抑制遺伝子およびファージ制御から切り離された遺伝子を、溶解性複製サイクル中に発現する遺伝子と明確に区別します。

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