Existing methods for the modification of plants have limited applicability. The novel peptide-derived technology proposed here promises both simplicity and efficiency in the introduction of exogenous protein or genes into the desired intracellular compartments of intact plants.
The capacity to introduce exogenous proteins and express (or down-regulate) specific genes in plants provides a powerful tool for fundamental research as well as new applications in the field of plant biotechnology. Viable methods that currently exist for protein or gene transfer into plant cells, namely Agrobacterium and microprojectile bombardment, have disadvantages of low transformation frequency, limited host range, or a high cost of equipment and microcarriers. The following protocol outlines a simple and versatile method, which employs rationally-designed peptides as delivery agents for a variety of nucleic acid- and protein-based cargoes into plants. Peptides are selected as tools for development of the system due to their biodegradability, reduced size, diverse and tunable properties as well as the ability to gain intracellular/organellar access. The preparation, characterization and application of optimized formulations for each type of the wide range of delivered cargoes (plasmid DNA, double-stranded DNA or RNA, and protein) are described. Critical steps within the protocol, possible modifications and existing limitations of the method are also discussed.
Plant genetic engineering is conventionally used for transferring beneficial traits to plants. In recent years, this technology has been applied to convert plants into bio-factories for the production of pharmaceutically important and commercially valuable proteins, many of which cannot be chemically synthesized and are very costly to produce using animal or microbial systems1. By the introduction of new genes, the plant’s own metabolism can be manipulated for the production of various biopharmaceuticals like antibodies, metabolic enzymes, hormones, antigens or vaccine2.
Established gene transfer technologies for plants are the Agrobacterium-mediated delivery3, bombardment with DNA-coated microprojectiles (biolistics)4, and electroporation5 or polyethylene glycol6 treatment of protoplasts. Techniques requiring protoplasts are generally avoided because they are time-consuming, cumbersome and yield inconsistent results7. As a result, virtually all plant modification work at present utilizes either Agrobacterium or microprojectiles for gene transfer. The Agrobacterium method is more extensively used but not applicable to many economically important plant species. Meanwhile, microprojectile bombardment is more versatile due to a broad range of susceptible plants but requires specialized equipment and often causes severe tissue damage. Furthermore, these methods involve either a random (biolistics) or complex (Agrobacterium) delivery mechanism and have variable transformation rates8. Hence, a novel plant transformation technology that is simple yet effective, and applicable to different plant types is required.
Currently, plants are subjected to genetic modification primarily by the delivery of exogenous DNA encoding a desired trait, rather than by direct delivery of a target protein. The higher stability of DNA over proteins is a prime advantage; nevertheless, potential problems associated with DNA delivery include the random insertion of exogenous DNA into the plant genome and unintended transmission of antibiotic resistance genes to pathogenic bacteria via horizontal gene transfer9. For genome-editing purposes, the ability to edit plant genomes without introducing foreign DNA into cells may circumvent regulatory concerns related to genetically modified plants. Thus, an alternative DNA-free strategy for the modification of plants by direct delivery of protein will be able to cater to these needs.
Here we introduce a peptide-based system, originally developed for human gene therapy10-14, for the targeted delivery of exogenous genes or proteins in intact plants. Peptides are able to protect DNA from nuclease degradation and can mediate gene transfer across cell as well as organellar membranes15-17. They also have diverse and tunable properties besides being non-cytotoxic18-20. More importantly, with the use of peptides, genes can be precisely targeted to intracellular organelles such as the mitochondria21 or plastids (chloroplasts)22 for expression-a task not achievable by biolistic or Agrobacterium-mediated transformation. Depending on the cargo type, this new plant modification technology can be exploited to deliver proteins23 and either express (plasmid21,24 or double-stranded DNA25) or down-regulate (double-stranded RNA26) specific genes within the plant, throughout its cytosolic space24-26 or within a specific organellar compartment21. The designed carrier peptides consist of a cationic domain in the form of either polylysine (K8) or polylysine-co-histidine (KH)9 for binding and/or condensation of negatively-charged cargoes, which is conjugated to cell penetrating (BP100 peptide) or mitochondria transit (Cytcox peptide) sequences.
Критические шаги в рамках протокола, которые были определены эмпирически обсуждаются. С помощью шприца инфильтрации, препараты на основе пептидов, вводятся в воздушном пространстве внутри листа растения через устьица. Для того, чтобы обеспечить максимальное поглощение раствора, процесс инфильтрации следует проводить , когда растения в условиях, которые способствуют устьичным открытию то есть., При условии , с достаточным количеством воды и в течение светового периода. Что касается подготовки трансфекцию комплексов, для составов, которые включают комбинацию двух пептидов (для доставки ДНК митохондриальной-мишенью), последовательность для добавления каждого компонента имеет решающее значение и не должна быть перевернутой.
Есть много правдоподобных изменения в процедуре. Еще один вариант для инфильтрации клеток растений является использование вакуумной пропитки, которая способна ввести комплексное решение в целые растения и / или частичной тканей, включаяапикальные меристемы. Для этой альтернативной процедуры, рассаду погружают в раствор для трансфекции, а также на основании давления, создаваемого вакуума, пептид-грузовые комплексы вынуждены через устьица и в клетках растений (Yoshizumi, T., неопубликованные данные).
Кратковременная экспрессия гена, основанный на исследованиях с использованием животных клеток, было показано , что увеличение с более высокими концентрациями ДНК 29-31. Важно отметить , что отношение пептида к ДНК влияет на биофизические свойства (размер, поверхность заменяющим ) комплексов (рис 4), который влияет на эффективность трансфекции; следовательно, оптимальное соотношение должно поддерживаться даже с повышенной концентрацией ДНК.
Одним из главных преимуществ в использовании пептидов, как ген / белок агента доставки является то, что его последовательность поддается настройке для выполнения требуемой функции. Например, митохондриальная-направляющий домен пептида-носителя описано в данном шпилькеу может быть заменен хлорпластического или пероксисом нацеливания последовательностей для локализации этих органелл. В то время как трансформация хлоропластов возможно в нескольких растений с использованием биолистики 32-34, ни Agrobacterium , ни биолистической метод может ввести гены в митохондрии или других органеллах , помимо ядра (таблица 2).
Там нет жестких ограничений хост-диапазона для пептидной основе трансфекции, в отличие от метода Agrobacterium -На (таблица 2). До сих пор, составы для трансфекции A. thaliana, Н. benthamiana и тополя были оптимизированы (таблица 1), но метод может быть применен для Nicotiana аЬасит, томатный сорт Микро-Том, рис (на основе предварительных экспериментов), и другие моно- и двудольных растений.
Пока еще не существует известное ограничение размера трансгена, когда пептиды используютs трансфекции векторов. В противоположность этому , большие молекулы ДНК было обнаружено, что снижает эффективность трансформации Agrobacterium опосредованной методов 35,36, а верхний предел размера для трансгенов приблизительно 200 кб было сообщено 37-39. Использование биолистики, с другой стороны, большие ДНК – фрагменты могут быть стриженый во время приготовления или доставки в растения 38. Хотя верхний предел не был определен для баллистической трансформации до сих пор, физические сдерживает были найдены , чтобы ограничить размер ДНК , которые могут быть переданы намного меньше , чем 150 кб 40. Основные преимущества использования системы на основе пептидов для переноса генов по сравнению с существующими подходами по принципу либо Agrobacterium или бомбардировки микрочастицами, рассмотренных выше, приведены в таблице 2.
существует несколько ограничений для этого метода в его нынешнем виде. Во-первых, направленную доставку пДНК к конкретным органелл, таких как МИТochondria, было доказано, возможно, с помощью простого сочетания ДНК-связывающих клеток, проникающих и органелл транзитных последовательностей хотя эффективность была низкой. экспрессии трансгена может быть обнаружена, с помощью конфокальной микроскопии, только в небольшой популяции митохондрий в клетках. Следовательно, дальнейшие модификации необходимы для: (I) повышения транслокацию более комплексов через клеточную / органоидного мембраны, и (II), улучшение диссоциации и передачи пДНК от пептида-носителя в целевую органеллы для экспрессии. Во-вторых, с помощью этой системы доставки ДНК, временной экспрессии экзогенных генов репортер был успешно достигнут в цитозольной и митохондриальной отделении клеток. Стабильное включение и экспрессия введенных генов в растении ядерном / органоидного генома еще не были установлены, однако, из-за отсутствия подходящих стратегий отбора.
Признавая, что есть области для улучшения или дальнейшего гАЗВИТИЕ, стратегия пептид, полученных описанным здесь остается простой и универсальный метод, который проложил путь для доставки различных грузов в различных видах растений.
The authors have nothing to disclose.
Авторы хотели бы отметить финансирование из Японии науки и технологии агентства Поисковое исследование перспективных технологий (JST-ERATO), в новых энергетических и промышленных технологий развития организации (NEDO), а также стратегической программы продвижения инноваций межведомственный (SIP), Япония ,
(KH)9-BP100 peptide | Custom-synthesized by RIKEN Brain Science Institute | N/A | Sequence: KHKHKHKHKHKHKHKH- KHKKLFKKILKYL |
(BP100)2-K8 peptide | Custom-synthesized by RIKEN Brain Science Institute | N/A | Sequence: KKLFKKILKYLKKLFKKIL- KYLKKKKKKKK |
BP100 peptide | Custom-synthesized by RIKEN Brain Science Institute | N/A | Sequence: KKLFKKILKYL |
Cytcox-(KH)9 peptide | Custom-synthesized by RIKEN Brain Science Institute | N/A | Sequence: MLSLRQSIRFFKKHKHKH- KHKHKHKHKHKH |
P35S-GFP(S65T)-TNOS and P35S-RLuc-TNOS | N/A | N/A | Encodes green fluorescent protein and Renilla luciferase genes, respectively, under the control of CaMV 35S constitutive promoter (Ref: Lakshmanan et al. Biomacromolecules 2013, 14, 10) |
pDONR-cox2:gfp and pDONR-cox2:rluc | N/A | N/A | Encodes green fluorescent protein and Renilla luciferase genes, respectively, under the control of cox2 mitochondrial-specific promoter (Ref: Chuah et al. Sci Rep 2015, 5, 7751) |
dsDNA (PCR-amplified from pBI221-P35S-Rluc-TNOS) | N/A | N/A | Encodes green fluorescent protein and Renilla luciferase genes, respectively, under the control of CaMV 35S constitutive promoter (Ref: Lakshmanan et al. Plant Biotechnol 2015, 32, 39) |
GFP5 siRNA | N/A | N/A | For RNA interference-mediated silencing of green fluorescent protein (Ref: Numata et al. Plant Biotechnol J 2014, 12, 1027) |
CHS siRNA | N/A | N/A | For RNA interference-mediated silencing of chalcone synthase (Ref: Numata et al. Plant Biotechnol J 2014, 12, 1027) |
1 mL and 10 mL Plastic Syringes | TERUMO Corporation | SS-01T, SS-10ESZ | |
1.5 mL Microcentrifuge Tube | AS ONE Corporation | 151212 | |
96-Well Flat-Bottom Plate | Asahi Glass Co., Ltd. | 3860-096 | |
Adhesive Tape | Sekisui Chemical Co., Ltd. | No. 835 | |
Alcohol Dehydrogenase | Sigma-Aldrich Co., LLC. | A-7011 | |
Atomic Force Microscope | Seiko Instruments Inc. | SPI3800, SPA 300HV | |
Atomic Force Microscope | Hitachi High-Tech Science Corporation | AFM5300E | |
BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific Inc. | 23227 | |
Cantilever | Hitachi High-Tech Science Corporation | K-A102001593 | |
Confocal Laser Scanning Microscope | Carl Zeiss | LSM700 | |
Cork Borer | Sigma-Aldrich Co., LLC. | Z165220 | For excision of leaves into 1-cm diameter disks |
Coverslip | Matsunami Glass Ind., Ltd. | C02261 | |
Cuvette | Sarstedt | 759116 | |
Folded Capillary Cell | Malvern Instruments, Ltd. | DTS1070 | |
Forceps | Shimizu Akira Inc. | Stainless pincet 150 | |
Homogenization Pestle | Ieda Trading Corp. | 9993 | |
Mica | Nisshin EM Co., Ltd. | LC23Z | |
Microcentrifuge | Beckman Coulter | BKA46472 | |
Microplate Reader | Molecular Devices Corporation | Spectra MAX M3 | |
Microscope Slide | Matsunami Glass Ind., Ltd. | S011120 | |
Pipette | Eppendorf Research® plus | 3120000909 | |
Pipette Tips | AS ONE Corporation | 2-5138-01, 2-5138-02, 2-5138-03 | |
Plastic Petri Dish | AS ONE Corporation | 1-7484-01 | |
Renilla Luciferase Assay Kit | Promega corporation | E2810 | |
Rhodamine B Isothiocyanate | Sigma-Aldrich Co., LLC. | 283924 | |
RNase-Free Water | Qiagen | 129112 | |
Sodium Carbonate | Wako Pure Chemical Industries, Ltd. | 199-01585 | |
Surgical Blade and Handle | FEATHER Safety Razor Co., Ltd. | Stainless steel No. 14 (blade), No. 3L (handle) | |
Syringe Tip Cap | Musashi Engineering Inc. | NC-3E | |
Weighing Balance | Sartorius | CPA225D | |
Zeta Potentiometer | Malvern Instruments, Ltd. | Zetasizer Nano-ZS |