Aqui, um sistema de bicamada lipídica suportado por nanobar é desenvolvido para fornecer uma membrana sintética com uma curvatura definida que permite a caracterização de proteínas com capacidade de detecção de curvatura in vitro.
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Artigo de método
* These authors contributed equally
Aqui, um sistema de bicamada lipídica suportado por nanobar é desenvolvido para fornecer uma membrana sintética com uma curvatura definida que permite a caracterização de proteínas com capacidade de detecção de curvatura in vitro.
A curvatura da membrana desempenha papéis importantes em vários processos essenciais das células, como migração celular, divisão celular e tráfico de vesículas. Não é apenas gerado passivamente por atividades celulares, mas também regula ativamente as interações proteicas e está envolvido em muitas sinalizações intracelulares. Assim, é de grande valor examinar o papel da curvatura da membrana na regulação da distribuição e dinâmica de proteínas e lipídios. Recentemente, muitas técnicas foram desenvolvidas para estudar a relação entre a membrana curva e a proteína in vitro. Em comparação com as técnicas tradicionais, a recém-desenvolvida bicamada lipídica suportada por nanobarras (SLB) oferece alto rendimento e melhor precisão na geração de curvatura de membrana, formando uma bicamada lipídica contínua em matrizes padronizadas de nanobarras com uma curvatura de membrana pré-definida e controle plano local. Tanto a fluidez lipídica quanto a sensibilidade proteica a membranas curvas podem ser quantitativamente caracterizadas usando microscopia de fluorescência. Aqui, um procedimento detalhado sobre como formar um SLB em superfícies de vidro fabricadas contendo matrizes de nanobarras e a caracterização de proteínas sensíveis à curvatura em tal SLB são introduzidos. Além disso, os protocolos para reutilização de nanochips e processamento de imagens são cobertos. Além do nanobar-SLB, este protocolo é prontamente aplicável a todos os tipos de chips de vidro nanoestruturados para estudos de detecção de curvatura.
A curvatura da membrana é um parâmetro físico crítico de uma célula que ocorre em uma variedade de processos celulares, como morfogênese, divisão celular e migração celular1. É amplamente reconhecido agora que a curvatura da membrana está além de um simples resultado de eventos celulares; em vez disso, emergiu como um regulador eficaz das interações proteicas e da sinalização intracelular. Por exemplo, várias proteínas envolvidas na endocitose mediada por clatrina se ligam preferencialmente à membrana curva, resultando na formação de um hotspot para endocitose2. Existem muitas causas diferentes de deformação da membrana,....
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1. Limpeza de nanochip
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O projeto de nanobar é recomendado para sondar proteínas de detecção de curvatura positiva, que contém um meio círculo em cada extremidade com curvatura definida pela largura da nanobarra e um controle de curvatura plana/zero localmente no centro (Figura 2A,B). A formação bem-sucedida do SLB em nanobarras resulta em sinais de marcadores lipídicos distribuídos uniformemente em toda a superfície do nanobar, como mostrado na Figura 2C. Os sinais de.......
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O sistema nanobar-SLB descrito aqui oferece uma combinação única das vantagens em vários ensaios in vitro existentes. Revela eficientemente a ligação preferencial de proteínas a membranas altamente curvas como o ensaio de flutuação ou sedimentação de lipossomas, mas requer muito menos amostras e oferece curvatura mais precisamente definida em nanobarras individuais 8,29. Ele também oferece uma ampla gama de curvatura precisamente controlada para comparaç.......
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Os autores declaram não haver interesse financeiro concorrente neste trabalho.
Agradecemos ao Nanyang NanoFabrication Centre (N2FC) e ao Centre for Disruptive Photonic Technologies (CDPT) da Nanyang Technological University (NTU) por apoiar a fabricação de nanoestruturas e imagens MEV, a Plataforma de Produção de Proteínas (PPP) da Escola de Ciências Biológicas da NTU para purificação de proteínas e a Escola de Engenharia Química e Biomédica NTU para o microscópio confocal. Este trabalho é financiado pelo Ministério da Educação de Singapura (MOE) (W. Zhao, RG112/20, RG95/21 e MOE-T2EP30220-0009), pelo Institute for Digital Molecular Analytics and Science (IDMxS) apoiado pelo financiamento do MOE ao abrigo do esquema Research Centres of Excellenc....
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Etanol anidro | Sigma-Aldrich | 100983 | |
| Folha de alumínio | Diamante | RN0879999FU | |
| frasco de âmbar | Sigma-Aldrich | 27115-U | |
| Brain PS: L-&alfa;-fosfatidilserina (cérebro, suíno) (sal de sódio) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| Copo de 10 mL | Schott-Duran | SCOT211060804 | |
| Copo de 50 mL | Schott-Duran | SCOT211061706 | |
| Copo de 1000 mL | Schott-Duran | SCOT211065408 | O segundo recipiente |
| Cotonetes de clorofórmio | Sigma-Aldrich | V800117 | |
| Watsons | |||
| 18:1 DGS-NTA(Ni): 1,2-dioleoil-sn-glicero-3-[(N-(5-amino-1-carboxipentil)ácido iminodiacético)succinil] (sal de níquel) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| Ovo PC: L-&alfa;-fosfatidilcolina (ovo, frango) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| Plataforma de Produção de Proteínas F-BAR, Escola de Ciências Biológicas, Universidade Tecnológica de Nanyang, Proteínas de Cingapura | e Plataforma de Produção de | ||
| Pe F-BAR + IDR | , Escola de Ciências Biológicas, Universidade Tecnológica de Nanyang, Proteínas de Cingapura | e peptídeo | |
| GFP | Plataforma de Produção de Proteínas, Escola de Ciências Biológicas, Universidade Tecnológica de Nanyang, Cingapura | Proteínas e peptídeos | |
| GFP-His | Plataforma de Produção de Proteínas, Escola de Ciências Biológicas, Universidade Tecnológica de Nanyang, Cingapura | Proteínas e peptídeos | |
| GraphPad Prism | GraphPad V9.0.0 | ||
| Peróxido de hidrogênio, 30% (Certificado ACS) | Thermo Scientific | H325-500 | |
| IDR do humano FBP17 | Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. | ||
| Microscopia | 1.50d | National Institutes of Health | |
| Zeiss | LSM 800 com objetiva de óleo Airyscan | 100x (N.A.1.4). | |
| Metanol | Fisher científico | 10010240 | |
| Mini-extuder | Avanti Lipídios Polares, Inc. | 610000-1EA | |
| 1.5 mL Microtubos | Greiner | 616201 | |
| MATLAB | Mathworks | R2018b | |
| Membrana Hidrofílica de Nucleporos, 0.1 μ m | Whatman | 800309 | |
| Tampão de fosfato salino (PBS) | Life Technologies Holdings Pte Ltd. | 70013 | |
| Base de Polidimetilsiloxano (PDMS) Dow | Corning Corporation | SYLGARD 184 | |
| Polidimetilsiloxano (PDMS) Reticulador | Dow Corning Corporation | SYLGARD 184 | |
| Limpador de Plasma | HARRICK PLASMA | PDC-002-HP | |
| Nanochip de Quartzo | Donghai County Alfa Quartz Products CO., LTD | ||
| Hidróxido de Sódio | Sigma-Aldrich | 795429 | |
| ácido sulfúrico | Sigma-Aldrich | 258105 | |
| Texas Red DHPE: Texas Red 1,2-Dihexadecanoil-sn-Glicero-3-Fosfoetanolamina, Sal de Trietilamônio | Life Technologies Holdings Pte Ltd. | Pinça T1395MP | |
| Gooi | PDC-002-HP | ||
| Limpadores Ultrassônicos | Elma | D-78224 | |
| Voterx | Scientific Industries | G560E | |
| Dessecador a Vácuo | NUCERITE | 5312 | |
| Banho-maria | Julabo | TW8 |
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