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社区环境转录从海洋微生物基因表达分析

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Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics

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社区环境转录从海洋微生物基因表达分析

DOI:

•

13:51 min

•

February 18, 2009

•

Rachel S. Poretsky, Scott Gifford, Johanna Rinta-Kanto, Maria Vila-Costa, Mary Ann Moran

¹Department of Marine Sciences,University of Georgia (UGA)

Capítulos

00:00Título
01:06Introduction
01:51Preparation and Environmental RNA Collection
03:32Total RNA Extraction
06:03First rRNA Removal
07:29Second rRNA Removal
10:38mRNA Amplification
12:01cDNA Synthesis
12:51Representative Results/ Outcome
13:16Conclusion

Summary

Tadução automática

我们提出了一个方法生成环境的mRNA的cDNA。在一般情况下，总RNA是第一次从环境中收集，rRNA的选择性去除，mRNA的选择性扩增，并从丰富的mRNA池合成cDNA测序。使用标准的生物信息学技术确定基因表达，恢复序列，可以注明。

Tags

Gene Expression Marine Microbial Communities Environmental Transcriptomics Metatranscriptomics MRNA Sequencing Prokaryotic MRNA Poly(A) Tails Eukaryotic Messages Clone Libraries Random Primers CDNA Synthesis Linear Amplification In Vitro Transcription

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