Journal
/
Biologia
/
PAR-Clip - метод идентификации транскриптома всей места связывания РНК-связывающие белки
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
PAR-CliP – A Method to Identify Transcriptome-wide the Binding Sites of RNA Binding Proteins
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

PAR-Clip - метод идентификации транскриптома всей места связывания РНК-связывающие белки

DOI:
10.3791/2034-v

•

12:24 min

•

July 02, 2010

•

, , , , , , , , , , , , , ,
1Howard Hughes Medical Institute, Laboratory of RNA Molecular Biology,Rockefeller University, 2Berlin Institute for Medical Systems Biology,Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine, 3Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 4Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 5Genomics Resource Center,Rockefeller University

Capítulos

  • 00:00Título
  • 00:53Introduction
  • 01:27In vivo UV Crosslinking
  • 04:06Immunoprecipitation of Protein
  • 07:07Recovery of Crosslinked RNA-Protein Segments
  • 10:19Representative PAR-CLiP Results
  • 12:01Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

РНК-транскрипты подвергаются обширные посттранскрипционные регулирование, которое опосредуется множеством транс действия РНК-связывающими белками (ОДП). Здесь мы представляем обобщению метода точно определить и на транскриптома масштабе РНК места связывания ОДП.

Tags

PAR-CliPTranscriptome-wideBinding SitesRNA-binding ProteinsPost-transcriptional Gene RegulationRNA TranscriptsRNA-RBP InteractionsMicroRNA-containing Ribonucleoprotein ComplexesCell-type DependentlyInterplayHigh Resolution MapsIn Vivo Protein-RNA InteractionsGenetic ApproachesBiochemical ApproachesComputational ApproachesMicroarray ProfilingRIP-ChipKinetically Stable InteractionsRBP Recognition Element (RRE)Direct RBP Target Site InformationUV CrosslinkingImmunoprecipitationCLIPUV 254 Nm RNA-protein Crosslinking

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Актина сотрудничества седиментации Пробирной; для анализа связывание белка с F-актин

Протеомики для идентификации белков Взаимодействие с P2X2 лиганд-Gated Каналы Катионит

Профилирование метилтрансферазы и других S-Аденозил- L-Гомоцистеин-связывающих белков Захват соединения масс-спектрометрия (CCMS)

Сбор переменной концентрации Изотермические наборов калориметрия титрования с целью определения обязательных механизмов

iCLIP - транскриптома всей карты белка-РНК взаимодействия с отдельными нуклеотидных Резолюцию

Раскрывающееся кальмодулина-связывающие белки

Измененный Дрожжи-Two-гибридная система для идентификации белков Взаимодействие с фактор роста Progranulin

Выделение Рибосома связанных стадии становления Полипептиды<em> В пробирке</em>, Чтобы определить Поступательное сайтов Пауза Наряду мРНК

Очистки белков-Free метод привязки Определение Affinity по Микромасштабные Термофорез

Чувствительностью и специфичностью Количественный метод определения Сыворотка Сердечная Миозина связывающий белок-C по электрохемилюминесценцию иммуноферментного

Read Article