Journal
/
/
Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
DOI:

09:06 min

October 05, 2018

, ,

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Tadução automática

Identifiering av fysiska interaktioner mellan gener och reglerande element är utmanande men har underlättats med kromosomen konformation fånga metoder. Denna ändring av protokollet 4C-seq mildrar PCR partiskhet genom att minimera överdriven amplifiering av PCR-mallar och maximerar mappability av läser genom att införliva ett tillägg restriktionsenzym digest steg.

Vídeos Relacionados

Read Article