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Comparative Lesions Analysis Through a Targeted Sequencing Approach

Análise comparativa de lesões por meio de uma abordagem de sequenciamento direcionada

DOI:
10.3791/59844-v

•

08:16 min

•

November 05, 2019

•

, , , , , , , ,
1ARC-Net Research Centre,University and Hospital Trust of Verona, 2Department of Diagnostics and Public Health, Section of Pathology,University and Hospital Trust of Verona, 3Department of Medicine (DIMED), Surgical Pathology and Cytopathology Unit,University of Padua

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:48Library Pooling and Sequencing Run
  • 02:28Sample Library Dilution and Loading
  • 03:00Next Generation Sequencing
  • 03:43Mutation and Copy-Number Variation (CNV) Analysis
  • 05:00Somatic Mutation Indexing
  • 05:36Results: Representative Comparative Lesion Analyses
  • 07:16Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Este artigo descreve um método para identificar alterações clonais e subclonais entre diferentes espécimes de um determinado paciente. Embora os experimentos descritos aqui se concentrem em um tipo específico de tumor, a abordagem é amplamente aplicável a outros tumores sólidos.

Tags

Targeted SequencingGenetic RelatednessMolecular AlterationsDisease ProgressionIntratumor HeterogeneityAnti-tumor StrategiesSolid Tumor TypesSequencing RunIon Proton SystemIon Gene Studio S5 SystemIon AmpliSeq 2.0 Library KitIon ChefCoverage Analysis PluginGRCH37HG19 GenomeBarcode SetClonal AmplificationNext Generation Sequencing

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