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Adaptação de organoides gastrointestinais para infecção por patógenos e sequenciamento de células únicas sob condições de nível de biossegurança 3 (BSL-3)
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JoVE Journal Imunologia e Infecção
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions

Adaptação de organoides gastrointestinais para infecção por patógenos e sequenciamento de células únicas sob condições de nível de biossegurança 3 (BSL-3)

DOI:
10.3791/62857-v

•

07:59 min

•

September 10, 2021

•

,
1Department of Infectious Diseases, Molecular Virology,Heidelberg University Hospital, 2Department of Molecular Genetics and Microbiology, College of Medicine,University of Florida, Gainesville, 3Department of Infectious Diseases, Virology,Heidelberg University Hospital, 4Research Group “Cellular Polarity and Viral Infection”,German Cancer Research Center (DKFZ)

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 01:04Preparation of Single-Cell Solution and Preparation of Gel Beads-in-Emulsion Under Biosafety Level 3 Conditions
  • 05:47Results: Characterization of Host/Pathogen Interactions at a Single-Cell Level Using scRNAseq Technology
  • 07:11Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Este protocolo descreve como infectar organoides intestinais humanos de seu lado apical ou basolateral para caracterizar interações hospedeiro/patógeno no nível de célula única usando a tecnologia de sequenciamento de RNA unicelular (scRNAseq).

Tags

Gastrointestinal OrganoidsPathogen InfectionSingle Cell SequencingBiosafety Level 3Viral InfectionIntestinal EpitheliumDifferentiated OrganoidsExtracellular MatrixDissociation EnzymeSingle Cell RNA Sequencing

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