Journal
/
Biologia
/
In Silico Идентификация и характеристика цирковых РНК во время взаимодействий хозяина и патогена
JoVE Journal
Biologia
Author Produced
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

In Silico Идентификация и характеристика цирковых РНК во время взаимодействий хозяина и патогена

DOI:
10.3791/64565-v

•

10:27 min

•

October 21, 2022

•

, , ,
1Institute of Biological Sciences, Faculty of Science,Universiti Malaya, 2Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR),Universiti Malaya

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Представленный здесь протокол объясняет полный конвейер in silico , необходимый для прогнозирования и функциональной характеристики цирковых РНК на основе данных транскриптома секвенирования РНК, изучающих взаимодействия хозяина и патогена.

Tags

Keywords: CircRNAHost-pathogen InteractionsIn Silico IdentificationCharacterizationBioinformaticsRNA-seq AnalysisDifferential Expression AnalysisCiriquantPrepDE.pyCiri DE ReplicateLinuxProgrammingProtocolWorkflow

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/64565?article_type=v

Идентификация и характеристика гликозилирования белков с использованием конкретных эндо-и exoglycosidases
check_url/pt/64565?article_type=v

Быстрое Генетический анализ эпителиальных мезенхимальных сигнализации во время регенерации волос
check_url/pt/64565?article_type=v

Живая съемка апоптоза клеток во время акции<em> Drosophila</em> Эмбриогенеза
check_url/pt/64565?article_type=v

MultiBac белкового комплекса добывающей платформы на EMBL
check_url/pt/64565?article_type=v

Пиросеквенирования для идентификации микроорганизмов и характеристика
check_url/pt/64565?article_type=v

Белки МУДРОСТЬ Workbench для<em> В кремнии</em><em> De Novo</em> Дизайн биомолекул
check_url/pt/64565?article_type=v

Быстрая идентификация химических генетических взаимодействий в<em> Saccharomyces Cerevisiae</em
check_url/pt/64565?article_type=v

Хроматина иммунопреципитации для идентификации Arabidopsis взаимодействий белок-ДНК<em> В Vivo</em
check_url/pt/64565?article_type=v

Завод промоутер анализ: Определение и характеристика корень конкреций конкретной промоутера в общей бин
check_url/pt/64565?article_type=v

Идентификация новых регуляторов транспирации растений путем масштабного теплового скрининга в Helianthus Annuus

Read Article